211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1222 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1222  hemolysin A  100 
 
 
260 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000687315 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  78.1 
 
 
250 aa  384  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1420  hemolysin A  86.18 
 
 
227 aa  370  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  75.31 
 
 
257 aa  368  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  74.9 
 
 
257 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  74.49 
 
 
252 aa  362  4e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  68.62 
 
 
367 aa  329  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  66.12 
 
 
249 aa  295  5e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  59 
 
 
271 aa  275  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2072  hemolysin A  54.36 
 
 
271 aa  275  6e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.759279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1786  hemolysin A  54.36 
 
 
271 aa  275  6e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.465576  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  58.87 
 
 
240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  55.04 
 
 
266 aa  270  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  53.85 
 
 
270 aa  270  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  54.76 
 
 
268 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  51.45 
 
 
270 aa  265  5.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  57.74 
 
 
282 aa  264  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1661  hemolysin A  60.08 
 
 
252 aa  263  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0132682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2583  hemolysin A  52.82 
 
 
269 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.175728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  57.92 
 
 
252 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  59.58 
 
 
264 aa  259  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  57.96 
 
 
272 aa  259  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0583  hypothetical protein  52.28 
 
 
270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0252  hemolysin A  53.11 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  51.87 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4080  hemolysin A  53.94 
 
 
279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000457386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3918  hemolysin A  53.94 
 
 
279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3929  hemolysin A  53.94 
 
 
279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000268336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  51.46 
 
 
269 aa  252  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4399  hemolysin A  53.94 
 
 
279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000782309  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4196  hemolysin A  53.94 
 
 
279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.6643e-39 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  58.26 
 
 
276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  55.34 
 
 
251 aa  251  7e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4248  hemolysin A  53.53 
 
 
279 aa  250  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000872961  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4306  hemolysin A  53.53 
 
 
279 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000462381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4286  hemolysin A  53.53 
 
 
279 aa  250  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000449467  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  57.14 
 
 
246 aa  251  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0948  hemolysin A  53.53 
 
 
279 aa  250  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000087786  decreased coverage  0.0000013909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  57.26 
 
 
267 aa  250  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4028  hemolysin A  52.92 
 
 
279 aa  248  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000205737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  52.28 
 
 
269 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2318  hemolysin A  52.28 
 
 
277 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  53.31 
 
 
272 aa  246  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2869  hemolysin A  53.5 
 
 
279 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0361209  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  56.67 
 
 
246 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  55.37 
 
 
267 aa  245  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  54.73 
 
 
270 aa  244  8e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  52.89 
 
 
268 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1693  hemolysin A  51.24 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256356  hitchhiker  0.00423085 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  52.94 
 
 
277 aa  239  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1180  hemolysin A  49.38 
 
 
273 aa  239  4e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000850767  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  53.69 
 
 
274 aa  238  5.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1772  hemolysin A  55.27 
 
 
279 aa  237  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  52.26 
 
 
266 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1181  hemolysin, putative  50.82 
 
 
288 aa  237  2e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  56.36 
 
 
264 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  52.26 
 
 
266 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2026  hemolysin A  52.8 
 
 
267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3836  hemolysin A  47.84 
 
 
284 aa  235  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.63638 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2875  hemolysin A  53.09 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0499  hemolysin A  49.59 
 
 
275 aa  231  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.298305  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0755  rRNA methylase  48 
 
 
270 aa  230  2e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000457361  hitchhiker  0.0000277654 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  50.63 
 
 
269 aa  228  5e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  49.37 
 
 
264 aa  229  5e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  50.83 
 
 
267 aa  228  6e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  50.83 
 
 
267 aa  228  6e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0702  hemolysin A  48.75 
 
 
243 aa  228  8e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0319  hemolysin A  51.85 
 
 
272 aa  227  1e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  49.19 
 
 
264 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1047  hemolysin A  51.44 
 
 
251 aa  227  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.940085  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  49.19 
 
 
264 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  48.32 
 
 
278 aa  226  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4511  hemolysin A  49.2 
 
 
272 aa  225  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1456  hemolysin A  50 
 
 
248 aa  226  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101694  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  47.54 
 
 
268 aa  224  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  50 
 
 
252 aa  223  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  50.21 
 
 
242 aa  223  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0454  hemolysin A  52.02 
 
 
253 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2981  hemolysin A  52.24 
 
 
249 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0907  hemolysin A  50.62 
 
 
270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  49.79 
 
 
265 aa  217  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  49.17 
 
 
247 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2302  hemolysin A  49.8 
 
 
316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0183  hemolysin A  47.7 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1441  hemolysin A  48.3 
 
 
276 aa  214  9e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3080  hemolysin A  51.04 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  47.76 
 
 
267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  53.09 
 
 
266 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2200  hemolysin A  50.61 
 
 
268 aa  212  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1557  hemolysin A  44.44 
 
 
270 aa  211  9e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16431  rRNA methyltransferase  45.82 
 
 
270 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16541  rRNA methyltransferase  44.44 
 
 
270 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.435905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  52.24 
 
 
269 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0476  hemolysin A  47.71 
 
 
281 aa  209  3e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763875  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16661  rRNA methyltransferase  44.72 
 
 
270 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.186835  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04661  rRNA methyltransferase  50.2 
 
 
267 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  51.26 
 
 
250 aa  208  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12600  predicted protein  48.87 
 
 
245 aa  207  9e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.78844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  50.84 
 
 
250 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  49.37 
 
 
245 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>