160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1173 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  55.12 
 
 		 1080 aa  1249    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  100 
 
 		 1079 aa  2197    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  45.03 
 
 		 1061 aa  917    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  37.51 
 
 		 1094 aa  700    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  39.96 
 
 		 1070 aa  789    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  50.66 
 
 		 1104 aa  1104    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  44.57 
 
 		 1061 aa  909    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2358  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1102 aa  267  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3774  membrane protein-like  26.87 
 
 		 1234 aa  115  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0394533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  23.81 
 
 		 1224 aa  85.5  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1313  hypothetical protein  23.61 
 
 		 809 aa  72.8  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000526597  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  24.34 
 
 		 1144 aa  72.8  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0549  hypothetical protein  23.76 
 
 		 1210 aa  68.9  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  26.74 
 
 		 632 aa  63.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  25.14 
 
 		 640 aa  62.4  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  30.18 
 
 		 797 aa  60.8  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1283 aa  58.9  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0928  hypothetical protein  25.64 
 
 		 655 aa  58.5  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.903286  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1232 aa  58.2  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  26.63 
 
 		 678 aa  57  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1341 aa  57  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  25.11 
 
 		 1379 aa  56.2  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  27.03 
 
 		 893 aa  56.6  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  29.31 
 
 		 696 aa  56.2  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  24.19 
 
 		 1384 aa  55.1  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  29.37 
 
 		 1077 aa  54.3  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1399 aa  53.9  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1398 aa  54.3  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1399 aa  53.9  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1399 aa  53.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  24.2 
 
 		 1323 aa  53.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1398 aa  53.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1399 aa  53.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1247 aa  53.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1307 aa  53.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1288 aa  52.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  25.76 
 
 		 1304 aa  53.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2735  hypothetical protein  26.5 
 
 		 1240 aa  52.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.37648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2055  hypothetical protein  22.29 
 
 		 587 aa  52.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.429866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  24.73 
 
 		 794 aa  52.4  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1365  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1247 aa  52.4  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3001  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1244 aa  52  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.11101 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  26.18 
 
 		 712 aa  52  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1399 aa  51.6  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1045  hypothetical protein  24.84 
 
 		 921 aa  51.6  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.665952  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1088 aa  51.6  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1243 aa  51.6  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1149 aa  51.6  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1091  hypothetical protein  27.47 
 
 		 853 aa  51.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  27.54 
 
 		 1515 aa  50.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  24.53 
 
 		 686 aa  50.8  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  26.09 
 
 		 742 aa  51.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1197 aa  50.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  25.45 
 
 		 506 aa  50.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1284 aa  50.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  20.31 
 
 		 640 aa  50.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  26.35 
 
 		 895 aa  50.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  19.29 
 
 		 695 aa  50.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0362  protein of unknown function DUF748  29.34 
 
 		 1330 aa  49.7  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1307  hypothetical protein  19.23 
 
 		 1162 aa  50.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.684486  normal  0.422338 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  22 
 
 		 765 aa  49.7  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  21.57 
 
 		 810 aa  49.7  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  23.35 
 
 		 812 aa  49.3  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  28.73 
 
 		 643 aa  49.3  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  24.53 
 
 		 686 aa  48.9  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1368 aa  48.9  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1397 aa  48.9  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  24.53 
 
 		 686 aa  48.9  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2847  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1237 aa  48.9  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1397 aa  48.9  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  24.53 
 
 		 686 aa  48.9  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  24.53 
 
 		 686 aa  48.9  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1397 aa  48.9  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  24.53 
 
 		 686 aa  48.9  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1397 aa  48.9  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  23.2 
 
 		 611 aa  48.9  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1372 aa  48.9  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  24.08 
 
 		 669 aa  48.9  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  23.08 
 
 		 782 aa  48.5  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  24.06 
 
 		 688 aa  48.9  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1307 aa  48.5  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1397 aa  48.5  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1265 aa  48.5  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1307 aa  48.5  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1305 aa  48.5  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1276 aa  48.5  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1390 aa  48.5  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1417 aa  48.1  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  30.83 
 
 		 709 aa  48.1  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  22.63 
 
 		 1273 aa  48.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  22.94 
 
 		 1273 aa  47.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  26.8 
 
 		 739 aa  47.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1397 aa  47.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  22.73 
 
 		 789 aa  47.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  26.8 
 
 		 729 aa  48.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0555  hypothetical protein  24.79 
 
 		 843 aa  47.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  23.46 
 
 		 599 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1275 aa  47.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  26.8 
 
 		 745 aa  47.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0634  hypothetical protein  24.79 
 
 		 856 aa  47.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>