More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1169 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
341 aa  688    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  72.22 
 
 
342 aa  489  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  60.3 
 
 
342 aa  421  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  61.19 
 
 
342 aa  421  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  56.65 
 
 
346 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  53.73 
 
 
349 aa  351  8.999999999999999e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  52.2 
 
 
347 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  59.84 
 
 
246 aa  166  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  59.06 
 
 
246 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  34.54 
 
 
285 aa  151  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  31.67 
 
 
289 aa  146  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  32.97 
 
 
301 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  29.49 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  48.3 
 
 
240 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  35.75 
 
 
217 aa  135  9e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  30.53 
 
 
255 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1954  NLP/P60 protein  34.65 
 
 
384 aa  133  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0958  NLP/P60 protein  49.65 
 
 
202 aa  131  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000015981  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  47.65 
 
 
210 aa  129  8.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  41.56 
 
 
476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  28.47 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  49.56 
 
 
265 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0091  NLP/P60  50.89 
 
 
170 aa  122  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  30.5 
 
 
295 aa  122  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  28.77 
 
 
338 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  32.43 
 
 
208 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  30 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  38.46 
 
 
424 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  46.28 
 
 
177 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  45.38 
 
 
274 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  46.28 
 
 
198 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  47.79 
 
 
458 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  48.33 
 
 
333 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  30.71 
 
 
208 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  48.21 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  46.49 
 
 
278 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  31.86 
 
 
216 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  45.31 
 
 
224 aa  113  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  39.47 
 
 
184 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  43.09 
 
 
269 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  37.87 
 
 
218 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  37.87 
 
 
234 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  37.87 
 
 
234 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  37.87 
 
 
234 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  48.18 
 
 
150 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  37.87 
 
 
218 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  44.74 
 
 
307 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  37.87 
 
 
218 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  43.09 
 
 
269 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  37.87 
 
 
218 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  44.09 
 
 
223 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  44.09 
 
 
223 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  44.88 
 
 
223 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  44.88 
 
 
223 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  44.19 
 
 
223 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  44.88 
 
 
223 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  37.28 
 
 
234 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  47.37 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  41.22 
 
 
150 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  43.31 
 
 
224 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  44.74 
 
 
266 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  47.37 
 
 
221 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
235 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1201  NLP/P60  46.09 
 
 
169 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  43.86 
 
 
267 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1177  putative transmembrane protein  43.88 
 
 
222 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0196017  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  43.36 
 
 
193 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  44.74 
 
 
284 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  41.94 
 
 
188 aa  106  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  41.94 
 
 
188 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  41.94 
 
 
188 aa  106  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  41.94 
 
 
188 aa  106  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  41.94 
 
 
188 aa  106  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  41.94 
 
 
188 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  41.94 
 
 
188 aa  106  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  41.94 
 
 
188 aa  106  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  41.94 
 
 
188 aa  106  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  48.15 
 
 
162 aa  106  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  45.8 
 
 
181 aa  105  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  44.55 
 
 
190 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  44.55 
 
 
190 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000518421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  44.55 
 
 
190 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  41.59 
 
 
230 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  44.55 
 
 
147 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  44.55 
 
 
147 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000243067  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  43.7 
 
 
226 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
257 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
232 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  42.98 
 
 
228 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  49.11 
 
 
245 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  42.98 
 
 
183 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0992  hypothetical protein  45.67 
 
 
170 aa  102  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.480266  normal  0.532227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5142  NLP/P60 protein  39.86 
 
 
208 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0699781  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  39.86 
 
 
208 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  40 
 
 
191 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  41.94 
 
 
210 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  43.33 
 
 
215 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  45.45 
 
 
171 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  42.52 
 
 
226 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  43.23 
 
 
226 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>