More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1039 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1039  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 247 aa  494  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000118071  hitchhiker  0.000000087208 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2702  ABC transporter, ATP-binding protein  73.28 
 
 		 246 aa  343  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0927  ABC-type transport system, ATPase component  49.76 
 
 		 216 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  44.3 
 
 		 334 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  43.64 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2223  ABC transporter related  46.58 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2396  ABC transporter related  45.89 
 
 		 337 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  40 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  38.56 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2629  ABC transporter-related protein  42.4 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  41.31 
 
 		 243 aa  148  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  41.4 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  40 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  42.65 
 
 		 349 aa  144  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1894  ABC transporter-related protein  41.41 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 364 aa  140  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2873  ABC transporter related  44.86 
 
 		 353 aa  138  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204327 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2071  ABC transporter related  40.91 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  42.71 
 
 		 348 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5610  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.48 
 
 		 360 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0069  ABC transporter related  41.67 
 
 		 356 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.675568 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  36.4 
 
 		 400 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  42.19 
 
 		 349 aa  131  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2906  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.41 
 
 		 388 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.2 
 
 		 377 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  42.71 
 
 		 351 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2782  ABC transporter related  44.39 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.7 
 
 		 375 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.2 
 
 		 377 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.2 
 
 		 377 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  42.71 
 
 		 348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6346  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  40.91 
 
 		 384 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.98 
 
 		 377 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0080  ABC transporter related  35.58 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 		 349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4264  ABC transporter related  34.63 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.03 
 
 		 386 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3044  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.41 
 
 		 384 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4459  ABC transporter related  34.63 
 
 		 236 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2813  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  40.91 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.91 
 
 		 384 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1671  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.03 
 
 		 386 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0354987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6066  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.41 
 
 		 381 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2997  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.91 
 
 		 384 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412177  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  35.98 
 
 		 377 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4319  ABC transporter related  35.41 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  37.86 
 
 		 353 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1945  ABC transporter related  36.03 
 
 		 371 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1695  ABC transporter related protein  39.2 
 
 		 366 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2991  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.6 
 
 		 384 aa  129  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4663  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.67 
 
 		 387 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1200  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.62 
 
 		 378 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0439594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1109  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.62 
 
 		 378 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000609618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.62 
 
 		 378 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0114763  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3191  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.62 
 
 		 378 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00351311 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 		 353 aa  128  7.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.62 
 
 		 378 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.4 
 
 		 384 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7682  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  40.91 
 
 		 379 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.3686 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  36.62 
 
 		 378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.62 
 
 		 378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.62 
 
 		 378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  41.15 
 
 		 348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.62 
 
 		 378 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  40 
 
 		 353 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1057  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.305313  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1787  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1300  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 378 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0108  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432666  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2309  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0939  ABC putrescine transporter, ATPase subunit PotG  37.21 
 
 		 387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301968  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2304  ABC transporter related  36.36 
 
 		 360 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297775  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  38.27 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2178  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.455758  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  38.98 
 
 		 364 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2122  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 		 386 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499153  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0353  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.61 
 
 		 366 aa  126  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00527297  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.38 
 
 		 376 aa  126  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  37.86 
 
 		 353 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3188  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.86 
 
 		 378 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1278  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.6 
 
 		 387 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296404  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.27 
 
 		 363 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1233  ABC transporter related  40.93 
 
 		 340 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02262  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.95 
 
 		 239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1229  ABC transporter related  37.67 
 
 		 370 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  36.21 
 
 		 353 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  40 
 
 		 386 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2294  ABC transporter related protein  40.19 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0725  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 		 384 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2019  putrescine ABC transport system, ATP-binding protein  38.14 
 
 		 384 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2526  ABC transporter related  37 
 
 		 366 aa  125  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00407865 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0633  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 		 384 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0393  polyamine transport protein PotG  37.95 
 
 		 384 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1949  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 		 384 aa  125  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.415824  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.24 
 
 		 353 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03940  polyamine transport protein PotG  37.95 
 
 		 384 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  36.29 
 
 		 364 aa  125  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2277  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.94 
 
 		 386 aa  125  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>