More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1034 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  95.24 
 
 		 421 aa  836    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  83.57 
 
 		 421 aa  742    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000044561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  73.57 
 
 		 421 aa  663    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  100 
 
 		 421 aa  870    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  80.76 
 
 		 421 aa  728    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  83.81 
 
 		 421 aa  744    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  73.4 
 
 		 421 aa  689    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  73.62 
 
 		 417 aa  673    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  87.86 
 
 		 421 aa  778    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  70.33 
 
 		 420 aa  630  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0394  acetate kinase  63.22 
 
 		 419 aa  570  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3448  acetate kinase  58.85 
 
 		 403 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0149  acetate kinase  56.22 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0328  acetate kinase  55.64 
 
 		 409 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000406693 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0720  acetate kinase  54.78 
 
 		 452 aa  483  1e-135  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0988409  hitchhiker  0.0000000373865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0348  acetate kinase  55.39 
 
 		 409 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  56.75 
 
 		 398 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  53.81 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  54.14 
 
 		 398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  53.38 
 
 		 397 aa  441  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  54 
 
 		 408 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  54.64 
 
 		 405 aa  444  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  54.86 
 
 		 403 aa  436  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  54.86 
 
 		 403 aa  437  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  52.38 
 
 		 399 aa  432  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  50.88 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  52.28 
 
 		 397 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  52.44 
 
 		 399 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  51.01 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  51.02 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  51.02 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  50.88 
 
 		 395 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  50.75 
 
 		 406 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  50.25 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  54.34 
 
 		 401 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  51.02 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  50.76 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  50.76 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  50.76 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  51.02 
 
 		 398 aa  412  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  50.76 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  50.13 
 
 		 404 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  50 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  50.25 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  51.99 
 
 		 406 aa  408  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  50.51 
 
 		 397 aa  409  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  49.75 
 
 		 397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  49.5 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  50.12 
 
 		 397 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  50.76 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  48.49 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  48.12 
 
 		 399 aa  398  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  48.25 
 
 		 401 aa  393  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  47.77 
 
 		 402 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  47.12 
 
 		 398 aa  393  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  46.87 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  48.61 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  50.13 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  47.87 
 
 		 396 aa  385  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  46.87 
 
 		 398 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  48.5 
 
 		 397 aa  385  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  50.13 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  47.65 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  47.41 
 
 		 401 aa  381  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  46.62 
 
 		 398 aa  377  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  46.92 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  47.12 
 
 		 398 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  46.97 
 
 		 397 aa  376  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  46.91 
 
 		 402 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  46.62 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  45.25 
 
 		 399 aa  375  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  48.21 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  47.12 
 
 		 406 aa  369  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  45.36 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  47.75 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  48.21 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  47.49 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  46.37 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  47.37 
 
 		 398 aa  364  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  46.48 
 
 		 399 aa  364  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  47.49 
 
 		 398 aa  363  3e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  48.58 
 
 		 394 aa  363  4e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0641  acetate kinase  42.64 
 
 		 405 aa  363  4e-99  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00773095  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  46.23 
 
 		 399 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  46.23 
 
 		 399 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  46.41 
 
 		 396 aa  362  7.0000000000000005e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  44.36 
 
 		 422 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  45.98 
 
 		 399 aa  362  8e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  43.64 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  47.49 
 
 		 398 aa  360  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  46.37 
 
 		 399 aa  359  6e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  46.37 
 
 		 399 aa  359  6e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  46.37 
 
 		 399 aa  359  6e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  46.37 
 
 		 399 aa  359  6e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  47.37 
 
 		 398 aa  358  7e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2295  acetate kinase  45.84 
 
 		 395 aa  358  7e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  45.86 
 
 		 399 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  45.54 
 
 		 403 aa  356  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  44.44 
 
 		 402 aa  355  5.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  45.23 
 
 		 413 aa  354  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>