More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1026 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  51.58 
 
 		 223 aa  242  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.87 
 
 		 225 aa  238  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  48.87 
 
 		 224 aa  228  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.87 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 223 aa  227  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 227 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.87 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.87 
 
 		 224 aa  226  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.87 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 223 aa  224  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.42 
 
 		 225 aa  224  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 223 aa  224  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.96 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.47 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.87 
 
 		 225 aa  222  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6324  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.42 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.27 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6987  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.42 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.67799  normal  0.586494 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1505  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.42 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228186  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5988  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.42 
 
 		 225 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5744  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.96 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0360294  normal  0.749662 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  47.27 
 
 		 225 aa  218  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  48.18 
 
 		 224 aa  218  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  47.3 
 
 		 223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 226 aa  215  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3961  heavy metal response regulator  48.18 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  48 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  49.1 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1751  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.96 
 
 		 224 aa  213  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.3 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.42 
 
 		 227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.06 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1376  DNA-binding response regulator IrlR  46.15 
 
 		 229 aa  211  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.498923  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3353  response regulator receiver domain-containing protein  45.54 
 
 		 225 aa  211  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371413  normal  0.100473 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1841  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 228 aa  211  7e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.99331  hitchhiker  0.00000222676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 228 aa  211  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 223 aa  211  7e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2165  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.77286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4663  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.06 
 
 		 225 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180214  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.49 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0902  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.25 
 
 		 223 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.34 
 
 		 223 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3852  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 231 aa  210  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3892  putative two-component response regulator  46.67 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3412  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.55 
 
 		 226 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0528  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.3 
 
 		 223 aa  210  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 226 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.7 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1196  two-component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4391  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.43 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.593256 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3380  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000549651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2215  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.8 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  46.85 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0781  hypothetical protein  44.34 
 
 		 223 aa  208  4e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5873  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 228 aa  208  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.247228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2069  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.34 
 
 		 228 aa  208  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 241 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  47.09 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4527  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 226 aa  208  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 227 aa  208  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  47.09 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0752  hypothetical protein  44.34 
 
 		 223 aa  208  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.89 
 
 		 223 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.89 
 
 		 223 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0836  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.98 
 
 		 224 aa  207  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.368612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 230 aa  207  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3720  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 224 aa  207  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6519  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.8 
 
 		 228 aa  207  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3908  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 227 aa  207  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4558  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.43 
 
 		 226 aa  207  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 228 aa  207  9e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 228 aa  207  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  45.25 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2007  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1233  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  45.98 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  45.25 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3615  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3303  response regulator receiver protein  46.82 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3817  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000444115  decreased coverage  0.00121668 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>