More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1014 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  100 
 
 		 476 aa  956    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  56.28 
 
 		 464 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  52.93 
 
 		 457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  53.8 
 
 		 458 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  51.94 
 
 		 475 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  51.63 
 
 		 466 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  50.65 
 
 		 464 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  50.57 
 
 		 485 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  48.64 
 
 		 471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  49.44 
 
 		 485 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  50.34 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  50.23 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  49.89 
 
 		 476 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  49.66 
 
 		 461 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  48.97 
 
 		 472 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  45.32 
 
 		 476 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  46.75 
 
 		 489 aa  378  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  47.88 
 
 		 482 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  47.54 
 
 		 481 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  44.12 
 
 		 478 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  46.94 
 
 		 474 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  45.61 
 
 		 476 aa  368  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  45.36 
 
 		 514 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  46.34 
 
 		 524 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  47.17 
 
 		 525 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  47.71 
 
 		 473 aa  361  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  46.27 
 
 		 511 aa  359  5e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  45.43 
 
 		 500 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  50 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  44.28 
 
 		 524 aa  356  5.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  45.83 
 
 		 501 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  44.23 
 
 		 520 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  44.07 
 
 		 524 aa  352  5.9999999999999994e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  42.71 
 
 		 477 aa  352  7e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  43.82 
 
 		 484 aa  352  1e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  44 
 
 		 480 aa  351  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  46.12 
 
 		 524 aa  349  6e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  46.12 
 
 		 523 aa  348  8e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  46.48 
 
 		 511 aa  348  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  46.37 
 
 		 516 aa  348  1e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  44.37 
 
 		 523 aa  348  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  46.27 
 
 		 511 aa  347  4e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  43.17 
 
 		 479 aa  346  6e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  43.97 
 
 		 475 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  43.86 
 
 		 501 aa  343  4e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  45.2 
 
 		 588 aa  342  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  42.12 
 
 		 483 aa  342  9e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  43.34 
 
 		 502 aa  341  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  41.91 
 
 		 483 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  44.07 
 
 		 513 aa  341  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  44.07 
 
 		 513 aa  341  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  44.57 
 
 		 481 aa  340  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  43.33 
 
 		 487 aa  340  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  45.57 
 
 		 471 aa  340  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  44.74 
 
 		 464 aa  340  5e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  45.05 
 
 		 493 aa  339  5e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  42 
 
 		 522 aa  339  5.9999999999999996e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  44.9 
 
 		 578 aa  339  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  45.27 
 
 		 528 aa  337  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  44.25 
 
 		 500 aa  336  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  44.86 
 
 		 491 aa  336  5e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  44.32 
 
 		 506 aa  335  9e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  43.63 
 
 		 508 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  44.1 
 
 		 493 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  41.36 
 
 		 483 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  41.36 
 
 		 469 aa  333  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  41.36 
 
 		 473 aa  333  5e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  42.83 
 
 		 504 aa  332  8e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  42.89 
 
 		 520 aa  332  9e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  43.75 
 
 		 498 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  43.05 
 
 		 506 aa  332  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  43.45 
 
 		 498 aa  331  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  41.88 
 
 		 465 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  44.49 
 
 		 511 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  43.64 
 
 		 535 aa  327  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  43.14 
 
 		 501 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  42.09 
 
 		 471 aa  326  6e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  43.33 
 
 		 523 aa  326  6e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  44.86 
 
 		 474 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  43.93 
 
 		 477 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  43.93 
 
 		 477 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  44.63 
 
 		 474 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  41.44 
 
 		 467 aa  323  3e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  41.56 
 
 		 492 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  43.15 
 
 		 498 aa  323  4e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  43.79 
 
 		 501 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  44.72 
 
 		 505 aa  323  4e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  44.32 
 
 		 473 aa  323  4e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  43.34 
 
 		 502 aa  323  4e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  41.78 
 
 		 477 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  42.22 
 
 		 477 aa  323  6e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  41.4 
 
 		 473 aa  322  8e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  42.99 
 
 		 515 aa  322  9.000000000000001e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  41.41 
 
 		 498 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  41.33 
 
 		 478 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  42.23 
 
 		 459 aa  320  3e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  41.49 
 
 		 474 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  44.7 
 
 		 473 aa  319  7.999999999999999e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1117  protease Do  42.09 
 
 		 491 aa  319  7.999999999999999e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0590546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1396  serine protease, DO/DeqQ family  42.09 
 
 		 479 aa  318  9e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.333333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>