64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0986 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  69.49 
 
 		 273 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  60.07 
 
 		 273 aa  351  8e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  59.93 
 
 		 273 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  59.56 
 
 		 273 aa  334  7e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  48.13 
 
 		 275 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  45.22 
 
 		 275 aa  226  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  41.7 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  38.83 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  36.4 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  35.42 
 
 		 274 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  37.09 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  31.39 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  30.47 
 
 		 284 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  35.96 
 
 		 285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  34.94 
 
 		 500 aa  155  7e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  31.88 
 
 		 278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  36.73 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  35.5 
 
 		 282 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  36.06 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  33.46 
 
 		 296 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  34.66 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  33.7 
 
 		 292 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  34.52 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  34.06 
 
 		 282 aa  135  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  32.97 
 
 		 284 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  34.24 
 
 		 280 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  33.21 
 
 		 283 aa  122  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  33.46 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  30.15 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  33.21 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  31.25 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  38.46 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  31.88 
 
 		 294 aa  106  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  28.52 
 
 		 253 aa  98.6  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  31.44 
 
 		 270 aa  96.3  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  27.78 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  28.79 
 
 		 246 aa  89  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  29.48 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  29.17 
 
 		 626 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 626 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  24.34 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 		 625 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  28.79 
 
 		 626 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  28.02 
 
 		 227 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0711  hypothetical protein  25.86 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  28.52 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0346  hypothetical protein  24.63 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1418  hypothetical protein  27.67 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0657187 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0252  hypothetical protein  26.82 
 
 		 216 aa  55.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0215  hypothetical protein  26.77 
 
 		 246 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.260844  normal  0.647762 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  30.39 
 
 		 223 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  30.39 
 
 		 223 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  29.83 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1168  protein of unknown function DUF191  26.92 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2188  protein of unknown function DUF178  24.53 
 
 		 221 aa  49.3  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.745567  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0737  hypothetical protein  28.49 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000184342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0657  protein of unknown function DUF191  26.06 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1581  protein of unknown function DUF191  26.91 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0885  hypothetical protein  25.28 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1291  conserved hypothetical protein (DUF178 domain protein)  30.39 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2834  protein of unknown function DUF191  26.32 
 
 		 280 aa  43.1  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185622  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0105  hypothetical protein  29.17 
 
 		 304 aa  42.4  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>