More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0939 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  86.79 
 
 		 440 aa  788    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  82.83 
 
 		 435 aa  743    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  75.8 
 
 		 434 aa  676    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  76.03 
 
 		 434 aa  680    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 441 aa  901    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  71.75 
 
 		 448 aa  645    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  75 
 
 		 435 aa  651    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  65.49 
 
 		 432 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  56.24 
 
 		 443 aa  502  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  56.98 
 
 		 459 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  53.94 
 
 		 447 aa  484  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  55.2 
 
 		 447 aa  477  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  59.08 
 
 		 437 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  54.48 
 
 		 439 aa  472  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  58.62 
 
 		 437 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  58.62 
 
 		 437 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  55.2 
 
 		 445 aa  474  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  58.4 
 
 		 423 aa  474  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  54.04 
 
 		 485 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  54.55 
 
 		 441 aa  468  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  54.32 
 
 		 447 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  54.38 
 
 		 457 aa  466  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  53.92 
 
 		 457 aa  466  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  59.54 
 
 		 444 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  54.84 
 
 		 457 aa  468  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  53.81 
 
 		 463 aa  465  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  55.28 
 
 		 447 aa  463  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  55.94 
 
 		 458 aa  462  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  54.13 
 
 		 505 aa  462  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  53.76 
 
 		 444 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  52.75 
 
 		 451 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  54.59 
 
 		 432 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  54.44 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  51.35 
 
 		 450 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  54.29 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  55.3 
 
 		 459 aa  451  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  53.69 
 
 		 446 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.48 
 
 		 739 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  51.28 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  53.77 
 
 		 441 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1076  recombination factor protein RarA  50.74 
 
 		 544 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  53.54 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  54.01 
 
 		 441 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  51.79 
 
 		 461 aa  439  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  51.76 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  53.33 
 
 		 441 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  52.52 
 
 		 443 aa  437  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  53.55 
 
 		 453 aa  437  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  53.73 
 
 		 426 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  51.67 
 
 		 443 aa  438  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  55.08 
 
 		 429 aa  438  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  52.36 
 
 		 731 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2129  recombination factor protein RarA  51.67 
 
 		 443 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081607  normal  0.0213472 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  52.89 
 
 		 441 aa  434  1e-120  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  52.62 
 
 		 440 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  52.02 
 
 		 726 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  52.86 
 
 		 440 aa  433  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  51.78 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  50.6 
 
 		 425 aa  429  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  51.88 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  52.13 
 
 		 440 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  51.95 
 
 		 441 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  50.56 
 
 		 446 aa  430  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  52.75 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  51.87 
 
 		 440 aa  427  1e-118  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  52.22 
 
 		 420 aa  425  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  51.9 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  52.14 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  51.4 
 
 		 440 aa  424  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  50.82 
 
 		 437 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  48.28 
 
 		 440 aa  422  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1774  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 442 aa  423  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000171512  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1548  recombination factor protein RarA  50.46 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.892659  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  50.84 
 
 		 425 aa  422  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  50.7 
 
 		 451 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  53.3 
 
 		 435 aa  420  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  50.56 
 
 		 441 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  52.11 
 
 		 461 aa  421  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  50.47 
 
 		 449 aa  419  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  49.89 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  48.59 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2231  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00515157  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  54.44 
 
 		 451 aa  420  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  51.65 
 
 		 459 aa  421  1e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  51.31 
 
 		 422 aa  418  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1965  recombination factor protein RarA  48.82 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00069227  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2052  recombination factor protein RarA  49.05 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00508723  hitchhiker  0.000142667 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  48.36 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2308  recombination factor protein RarA  48.58 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  48.36 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  48.12 
 
 		 443 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  48.96 
 
 		 438 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003877  ATPase AAA family  50.23 
 
 		 449 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000221838  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1797  recombination factor protein RarA  48.71 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311557  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  54.89 
 
 		 449 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  52.38 
 
 		 445 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  51.2 
 
 		 423 aa  415  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1393  recombination factor protein RarA  51.31 
 
 		 427 aa  413  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1745  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000175803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>