More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0880 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  80.55 
 
 		 513 aa  842    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  65.03 
 
 		 510 aa  640    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  67.91 
 
 		 513 aa  731    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 		 513 aa  1031    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  64.89 
 
 		 511 aa  637    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  56.19 
 
 		 519 aa  570  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  38.24 
 
 		 545 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  38.24 
 
 		 545 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  38.83 
 
 		 549 aa  305  9.000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  36.21 
 
 		 570 aa  299  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  35.25 
 
 		 544 aa  291  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  34.68 
 
 		 550 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1244  Ppx/GppA phosphatase  35.47 
 
 		 534 aa  282  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.199997  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1198  Ppx/GppA phosphatase  33.99 
 
 		 549 aa  276  8e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  33.72 
 
 		 519 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  34.28 
 
 		 521 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  31.87 
 
 		 521 aa  266  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  32.43 
 
 		 519 aa  266  8.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  31.84 
 
 		 519 aa  259  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  34.98 
 
 		 505 aa  257  3e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  35 
 
 		 550 aa  254  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05201  putative exopolyphosphatase  29.58 
 
 		 531 aa  254  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  34.66 
 
 		 557 aa  251  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  33.4 
 
 		 553 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0489  Ppx/GppA phosphatase  31.18 
 
 		 527 aa  251  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  31.64 
 
 		 519 aa  250  5e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  32.2 
 
 		 531 aa  250  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  32.2 
 
 		 531 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  33.07 
 
 		 501 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  34.19 
 
 		 500 aa  247  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  31.59 
 
 		 531 aa  247  4e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  32.82 
 
 		 532 aa  246  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  32.6 
 
 		 502 aa  244  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  31.95 
 
 		 502 aa  244  3.9999999999999997e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  33.79 
 
 		 501 aa  244  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  32.18 
 
 		 544 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  32.12 
 
 		 514 aa  241  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  32.38 
 
 		 544 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  33.79 
 
 		 500 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0574  Ppx/GppA phosphatase  33.86 
 
 		 511 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  33.59 
 
 		 545 aa  235  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  32.86 
 
 		 523 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  32.34 
 
 		 539 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  31.36 
 
 		 507 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  30.29 
 
 		 506 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1033  Ppx/GppA phosphatase  31.16 
 
 		 505 aa  224  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35316  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  33.2 
 
 		 548 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  27.29 
 
 		 502 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  27.29 
 
 		 502 aa  217  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0972  Ppx/GppA phosphatase  34.18 
 
 		 520 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  30.45 
 
 		 497 aa  206  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3517  Ppx/GppA phosphatase  33.62 
 
 		 508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.380715  normal  0.228242 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  30.72 
 
 		 508 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03657  guanosine pentaphosphatase/exopolyphosphatase  29.6 
 
 		 494 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0212494  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03606  hypothetical protein  29.6 
 
 		 494 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0115846  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4143  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.47 
 
 		 494 aa  167  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263273  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4198  Ppx/GppA phosphatase  29.6 
 
 		 494 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5212  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.6 
 
 		 494 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02496  exopolyphosphatase  30.58 
 
 		 506 aa  167  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.285903  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4142  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.6 
 
 		 494 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3995  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.6 
 
 		 494 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4224  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.6 
 
 		 494 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.133689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4289  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  29.6 
 
 		 494 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  30.79 
 
 		 497 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  25 
 
 		 510 aa  164  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0232  Ppx/GppA phosphatase  25.05 
 
 		 488 aa  160  5e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0978  fumarate reductase  28.95 
 
 		 482 aa  160  5e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0786435  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47430  Exopolyphosphatase  30.99 
 
 		 501 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160528  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2394  exopolyphosphatase  30 
 
 		 501 aa  158  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  32.63 
 
 		 500 aa  158  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69220  exopolyphosphatase  30.02 
 
 		 506 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4014  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  27.81 
 
 		 498 aa  157  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5986  exopolyphosphatase  30.84 
 
 		 501 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4206  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  27.04 
 
 		 498 aa  156  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  35.92 
 
 		 310 aa  156  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0404  Ppx/GppA phosphatase  29.62 
 
 		 505 aa  156  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1861  Ppx/GppA phosphatase  29.51 
 
 		 505 aa  156  9e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4302  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  28.39 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  31.21 
 
 		 500 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1158  Ppx/GppA phosphatase  29.72 
 
 		 503 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.776682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1441  exopolyphosphatase  29.72 
 
 		 503 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4140  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  28.39 
 
 		 493 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  31.21 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4194  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  28.39 
 
 		 493 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4125  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  28.39 
 
 		 493 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0157  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  27.22 
 
 		 498 aa  153  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0154  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  26.42 
 
 		 500 aa  153  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0661  Ppx/GppA phosphatase  27.27 
 
 		 489 aa  152  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  30.55 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4243  guanosine pentaphosphate phosphohydrolase  28.18 
 
 		 493 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2403  Ppx/GppA phosphatase  28.18 
 
 		 533 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  29.15 
 
 		 508 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  27.8 
 
 		 520 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1691  nucleoside diphosphate kinase  28.64 
 
 		 482 aa  152  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0110463  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5463  Ppx/GppA phosphatase  30.04 
 
 		 500 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  30.92 
 
 		 500 aa  152  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2071  Ppx/GppA phosphatase  30.68 
 
 		 511 aa  151  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0215  Ppx/GppA phosphatase  30.09 
 
 		 509 aa  152  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2160  exopolyphosphatase  30.68 
 
 		 511 aa  151  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1046  Ppx/GppA phosphatase  32.27 
 
 		 491 aa  151  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.223703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>