More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0844 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  100 
 
 
269 aa  541  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  67.04 
 
 
267 aa  318  6e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  55.19 
 
 
280 aa  276  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  54.72 
 
 
267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  53.38 
 
 
267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  45.93 
 
 
271 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  45.72 
 
 
278 aa  192  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  42.05 
 
 
268 aa  185  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3856  methyltransferase type 11  47.89 
 
 
264 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3874  Methyltransferase type 11  46.74 
 
 
262 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3733  methyltransferase type 11  46.74 
 
 
262 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3790  Methyltransferase type 11  48.28 
 
 
262 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  37.79 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  38.49 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  35.56 
 
 
283 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  36.19 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  35.82 
 
 
292 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  33.09 
 
 
309 aa  135  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  35.71 
 
 
269 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  30.18 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  36.79 
 
 
291 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  29.82 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  30.14 
 
 
269 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  30.14 
 
 
269 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  30.14 
 
 
269 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  35.76 
 
 
309 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  30.14 
 
 
269 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 
307 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  30.14 
 
 
269 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  29.43 
 
 
269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  29.79 
 
 
269 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  28.94 
 
 
269 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  36.88 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  34.73 
 
 
269 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  35.61 
 
 
268 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  30.68 
 
 
268 aa  121  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  35.85 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  34.73 
 
 
267 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  35.88 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  35.61 
 
 
272 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  37.02 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  27.86 
 
 
285 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  31.03 
 
 
312 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  32.68 
 
 
262 aa  115  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  35.5 
 
 
267 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  32.34 
 
 
266 aa  115  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  32.08 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  36.26 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  30.5 
 
 
558 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  35.88 
 
 
276 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  35.88 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  33.2 
 
 
275 aa  112  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  29.5 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  35.29 
 
 
306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  29.62 
 
 
281 aa  108  7.000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  29.62 
 
 
281 aa  108  8.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  27.57 
 
 
284 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1535  Methyltransferase type 11  34.63 
 
 
320 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  28.73 
 
 
315 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  28.41 
 
 
265 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  27.99 
 
 
284 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  28.02 
 
 
325 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  31.91 
 
 
260 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  29.66 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  30.22 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  30.38 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  30.48 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  25.87 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  31.94 
 
 
294 aa  96.3  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1049  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
252 aa  95.9  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.027968  normal  0.205367 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  27.31 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  29.02 
 
 
319 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  27.53 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  27.94 
 
 
275 aa  89.4  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0938  methyltransferase type 11  30.74 
 
 
304 aa  89  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.455368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  26.42 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  27.24 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  24.18 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_11990  predicted protein  27.92 
 
 
330 aa  86.3  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  26.72 
 
 
251 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  26.72 
 
 
251 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  26.72 
 
 
251 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  26.72 
 
 
251 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  26.72 
 
 
251 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  34.4 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  26.47 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  30.82 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  27.64 
 
 
267 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  30.6 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  31.82 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  27.64 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04918  conserved hypothetical protein  30.11 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0365995  normal  0.289567 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  30.71 
 
 
474 aa  82.8  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  27.64 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1735  methyltransferase type 11  30.63 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  29.77 
 
 
216 aa  78.2  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3105  methyltransferase type 11  31.19 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.344458  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1043  biotin synthesis protein  26.36 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0033  biotin biosynthesis protein BioC  28.73 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0936  putative biotin biosynthesis protein BioC  26.29 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>