More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0805 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  100 
 
 		 188 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1443  flavin reductase-like, FMN-binding  77.13 
 
 		 189 aa  315  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0520  flavin reductase domain protein FMN-binding  76.06 
 
 		 189 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2210  flavin reductase domain-containing protein  73.94 
 
 		 189 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0642  flavin reductase domain protein FMN-binding  75 
 
 		 190 aa  300  6.000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0563737  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0259  flavoredoxin  70.21 
 
 		 189 aa  282  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  64.89 
 
 		 194 aa  262  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  64.17 
 
 		 188 aa  261  6e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  63.1 
 
 		 200 aa  249  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  60.64 
 
 		 189 aa  246  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  60.64 
 
 		 190 aa  245  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  58.82 
 
 		 191 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  59.57 
 
 		 192 aa  241  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  57.98 
 
 		 190 aa  235  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0187  flavoredoxin  57.98 
 
 		 190 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871882  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.45 
 
 		 190 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.85 
 
 		 190 aa  231  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  55.32 
 
 		 189 aa  228  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.47 
 
 		 195 aa  197  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  45.7 
 
 		 189 aa  185  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  40.94 
 
 		 209 aa  148  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25740  conserved protein of DIM6/NTAB family  39.78 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  37.77 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.33 
 
 		 195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1855  flavin reductase domain-containing protein  39.78 
 
 		 186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165677  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  37.08 
 
 		 200 aa  124  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  35 
 
 		 195 aa  121  5e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2479  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.02 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.261608 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0249  flavoredoxin, putative  35.98 
 
 		 187 aa  115  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000303002  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00650  conserved protein of DIM6/NTAB family  29.51 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0678  flavoredoxin  36 
 
 		 184 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.616599 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.9 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1189  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.03 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00243403  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1555  flavin reductase domain-containing protein  36.56 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  34.07 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0995  hypothetical protein  29.05 
 
 		 185 aa  98.2  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418174  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  30.32 
 
 		 192 aa  94.7  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  30.32 
 
 		 192 aa  94.7  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.79 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.78 
 
 		 160 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0437  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.44 
 
 		 185 aa  85.1  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.85 
 
 		 185 aa  84.7  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  34.07 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.78 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1592  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.39 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  30 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  32.84 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  34.88 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  34.88 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  34.88 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  34.88 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  34.3 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  30.43 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  29.05 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  34.3 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.3 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.1 
 
 		 215 aa  72  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.56 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0883  hypothetical protein  28.26 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0253557  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  31.85 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  31.18 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  29.22 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  32.28 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.3 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  30.71 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  33.77 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  27.74 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  33.88 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.68 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  33.11 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78913  flavoprotein oxygenase  27.18 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2986  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25.13 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  27.22 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  31.9 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2530  hypothetical protein  30.88 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0339415  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  34.09 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4048  hypothetical protein  30.5 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.293698  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  35.21 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.76 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  31.18 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1355  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.62 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.71 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  27.86 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2753  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.13 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  30.53 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2559  hypothetical protein  25 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.75 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  29.01 
 
 		 202 aa  62  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  29.32 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.37 
 
 		 167 aa  62  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  34.95 
 
 		 180 aa  62  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  25.3 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  31.29 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  30.07 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.83 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3951  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.58 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00405255 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.25 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.99 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  26.98 
 
 		 152 aa  60.8  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  32.52 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>