More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0769 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
147 aa  300  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  75.35 
 
 
157 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3071  thioesterase superfamily protein  51.08 
 
 
144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1190  thioesterase superfamily protein  50.36 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  43.48 
 
 
155 aa  122  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  42.65 
 
 
164 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.88 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  42.03 
 
 
158 aa  111  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  40.28 
 
 
163 aa  111  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  37.93 
 
 
169 aa  110  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  39.55 
 
 
166 aa  110  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  39.55 
 
 
166 aa  110  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  37.5 
 
 
164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  39.55 
 
 
168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 
161 aa  106  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  45.93 
 
 
180 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 
167 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  36.5 
 
 
176 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  36.5 
 
 
176 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  41.61 
 
 
178 aa  104  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  39.26 
 
 
162 aa  103  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 
176 aa  103  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  40.3 
 
 
169 aa  103  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  38.4 
 
 
172 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  39.85 
 
 
168 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2659  thioesterase superfamily protein  39.46 
 
 
167 aa  101  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  36.03 
 
 
188 aa  100  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.5 
 
 
159 aa  100  5e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 
168 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  40.91 
 
 
176 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 
161 aa  100  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  44.04 
 
 
175 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  39.26 
 
 
170 aa  98.2  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  37.24 
 
 
162 aa  97.8  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 
182 aa  97.4  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  40 
 
 
162 aa  97.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  40.35 
 
 
133 aa  97.1  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  35.86 
 
 
178 aa  97.1  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 
185 aa  97.1  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  44.14 
 
 
173 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  38.33 
 
 
153 aa  97.1  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 
167 aa  96.7  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 
168 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.69 
 
 
171 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  38.69 
 
 
171 aa  96.3  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  38.69 
 
 
171 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  35.17 
 
 
187 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  36.51 
 
 
171 aa  96.7  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.69 
 
 
168 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  36.88 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  35.46 
 
 
173 aa  96.3  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 
167 aa  96.3  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.69 
 
 
168 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 
171 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.69 
 
 
168 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  40.46 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  37.5 
 
 
160 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  36.84 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  36.88 
 
 
166 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  37.5 
 
 
188 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 
174 aa  94.7  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  38.97 
 
 
170 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.96 
 
 
168 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.96 
 
 
168 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  42.48 
 
 
143 aa  94  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
169 aa  94.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  37.96 
 
 
168 aa  94  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.96 
 
 
168 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0857  thioesterase superfamily protein  38.85 
 
 
160 aa  94  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.424877  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.4 
 
 
161 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1421  thioesterase superfamily protein  40.71 
 
 
260 aa  92.8  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000458727 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  38.93 
 
 
161 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  43.36 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.5 
 
 
170 aa  92  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5521  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.24 
 
 
170 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5278  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.78 
 
 
170 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5105  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  37.78 
 
 
170 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.441022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5122  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  38.24 
 
 
170 aa  92  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000417727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5675  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.78 
 
 
170 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 
161 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 
160 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 
161 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 
170 aa  90.9  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1929  acyl-CoA thioester hydrolase  36.89 
 
 
173 aa  90.9  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.504595  normal  0.403739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0440  thioesterase family protein  36.11 
 
 
158 aa  90.5  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 
263 aa  90.1  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  36.76 
 
 
170 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  37.32 
 
 
187 aa  90.1  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  36.76 
 
 
170 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  33.57 
 
 
180 aa  89.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  36.76 
 
 
170 aa  89  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1943  acyl-CoA thioester hydrolase  46.43 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  36.62 
 
 
185 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
175 aa  87.8  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 
161 aa  87.8  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  35.92 
 
 
189 aa  87.4  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 
159 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>