22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0759 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0759  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  205  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1087  hypothetical protein  73.58 
 
 
105 aa  148  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1389  hypothetical protein  65.09 
 
 
105 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00337403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3358  hypothetical protein  53.19 
 
 
111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.887484 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0903  hypothetical protein  53.19 
 
 
111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2341  hypothetical protein  39.81 
 
 
111 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0826  hypothetical protein  27.66 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0244  hypothetical protein  29.7 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1649  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0328  hypothetical protein  26.04 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.348534  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0646  hypothetical protein  29.63 
 
 
108 aa  47.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000149489  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1336  hypothetical protein  28.72 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1004  hypothetical protein  32.1 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0131469 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2538  hypothetical protein  28.83 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2853  hypothetical protein  27.68 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0868  hypothetical protein  27.84 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.775127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12240  hypothetical protein  23.3 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00576975  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1208  hypothetical protein  24.49 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0697544  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1616  hypothetical protein  27.16 
 
 
102 aa  42  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2036  hypothetical protein  37.29 
 
 
255 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2909  hypothetical protein  27.37 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3187  hypothetical protein  27.37 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670946  normal  0.123063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>