More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0726 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 297 aa  597  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  62.28 
 
 		 302 aa  354  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3237  alpha/beta hydrolase fold protein  38.81 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  38.29 
 
 		 284 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  35.23 
 
 		 289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 		 329 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 		 275 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  30.29 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  30.29 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  30.29 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  30.29 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  30.29 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  29.93 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 345 aa  109  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  29.93 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  29.2 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  29.2 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  33.19 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  28.26 
 
 		 299 aa  102  9e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 		 405 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  29.89 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 279 aa  99.4  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  31.86 
 
 		 363 aa  97.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  26.73 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  31.15 
 
 		 274 aa  96.7  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  26.76 
 
 		 340 aa  95.9  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 312 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 281 aa  95.9  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  26.9 
 
 		 350 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  30.33 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  27.84 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 		 291 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  27.34 
 
 		 313 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  27.34 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0763  alpha/beta fold family hydrolase  27.21 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 		 361 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16031  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  26.35 
 
 		 323 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  23.67 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3781  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 288 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 		 304 aa  89.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  26.55 
 
 		 303 aa  89  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 281 aa  89  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 301 aa  89  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  24.01 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 308 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 		 288 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  29.74 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.99 
 
 		 343 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  24.63 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 		 325 aa  86.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 		 292 aa  86.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 287 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  26.57 
 
 		 264 aa  86.3  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 350 aa  86.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0379  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 286 aa  85.9  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0672  alpha/beta hydrolase superfamily protein  25.73 
 
 		 344 aa  85.9  8e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0529058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  23.08 
 
 		 284 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 288 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.59 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.59 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>