204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0668 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  100 
 
 
166 aa  345  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  80.61 
 
 
166 aa  274  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.42552e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  78.79 
 
 
166 aa  270  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  68.52 
 
 
166 aa  237  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  68.48 
 
 
166 aa  235  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  66.87 
 
 
166 aa  232  1e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  53.94 
 
 
165 aa  189  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  55.56 
 
 
166 aa  187  6e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  52.12 
 
 
165 aa  180  7e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  51.52 
 
 
165 aa  178  3e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  51.52 
 
 
166 aa  177  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  58.28 
 
 
168 aa  177  5e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  2.01822e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  53.05 
 
 
166 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  53.05 
 
 
166 aa  175  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  55.83 
 
 
164 aa  175  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  52.44 
 
 
166 aa  174  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  60 
 
 
168 aa  174  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  54.88 
 
 
165 aa  174  6e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  53.37 
 
 
163 aa  173  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  55.56 
 
 
164 aa  170  9e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  56.44 
 
 
168 aa  170  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  54.55 
 
 
165 aa  169  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  55.84 
 
 
165 aa  170  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  56.71 
 
 
164 aa  169  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  52.73 
 
 
166 aa  169  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  55.62 
 
 
164 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  59.04 
 
 
163 aa  165  3e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  55.76 
 
 
165 aa  164  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  3.83486e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  50 
 
 
173 aa  162  2e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  55.56 
 
 
167 aa  159  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.70126e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  44.85 
 
 
166 aa  159  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  56.05 
 
 
168 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  46.67 
 
 
167 aa  158  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  49.7 
 
 
172 aa  157  7e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  48.17 
 
 
166 aa  156  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  51.95 
 
 
166 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  52.74 
 
 
158 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  48.12 
 
 
164 aa  152  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.60498e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  48.17 
 
 
165 aa  152  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  47.83 
 
 
167 aa  151  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  2.49666e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  45.06 
 
 
167 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.56568e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  55.49 
 
 
169 aa  148  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  46.67 
 
 
166 aa  148  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  43.9 
 
 
166 aa  145  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  44 
 
 
182 aa  145  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  45.12 
 
 
166 aa  143  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  43.68 
 
 
185 aa  142  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  42.77 
 
 
168 aa  140  1e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  44.07 
 
 
182 aa  138  4e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  45.34 
 
 
170 aa  137  5e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  45.34 
 
 
170 aa  137  5e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  2.07736e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  43.68 
 
 
184 aa  137  8e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  42.86 
 
 
170 aa  137  8e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  43.18 
 
 
185 aa  136  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  43.83 
 
 
168 aa  135  3e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  3.46492e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  39.66 
 
 
182 aa  134  7e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  42.59 
 
 
169 aa  132  2e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  37.7 
 
 
184 aa  132  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  40.37 
 
 
169 aa  131  4e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  40.23 
 
 
184 aa  129  1e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  39.76 
 
 
166 aa  124  7e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  36.11 
 
 
184 aa  110  1e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  41.46 
 
 
178 aa  110  1e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.07395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  40.85 
 
 
178 aa  109  2e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  35.67 
 
 
179 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  35.67 
 
 
179 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  37.35 
 
 
392 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  39.16 
 
 
178 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.418e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  36.75 
 
 
178 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  36.21 
 
 
228 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.98251e-06 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  36.14 
 
 
167 aa  99.8  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  2.23416e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  40 
 
 
182 aa  99.4  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  39.39 
 
 
177 aa  99.4  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.07911e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  35.12 
 
 
179 aa  99  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  46.09 
 
 
140 aa  98.2  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  39.76 
 
 
181 aa  98.2  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  1.48271e-09  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  37.72 
 
 
215 aa  96.7  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  42.22 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  36.31 
 
 
221 aa  96.7  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  2.56435e-05  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  37.28 
 
 
179 aa  96.7  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  36.09 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  43.08 
 
 
139 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  36.14 
 
 
233 aa  95.5  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  36.84 
 
 
216 aa  95.1  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  1.15937e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2946  rubrerythrin  40.22 
 
 
202 aa  94.4  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  43.61 
 
 
168 aa  94.4  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  35.67 
 
 
179 aa  94.4  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  45.8 
 
 
140 aa  93.6  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7438e-05 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  37.13 
 
 
183 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  37.13 
 
 
183 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  42.42 
 
 
140 aa  93.6  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  43.08 
 
 
139 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  37.13 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  43.08 
 
 
139 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  43.08 
 
 
139 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  42.86 
 
 
139 aa  92  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  35 
 
 
191 aa  92  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  36.02 
 
 
194 aa  91.3  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  39.69 
 
 
146 aa  90.9  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  34.27 
 
 
192 aa  90.5  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>