More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0650 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 122 aa  243  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  90.98 
 
 		 122 aa  227  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  87.7 
 
 		 122 aa  221  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  84.43 
 
 		 122 aa  214  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  84.43 
 
 		 122 aa  214  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  84.43 
 
 		 122 aa  210  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  81.97 
 
 		 122 aa  204  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  76.23 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  72.95 
 
 		 123 aa  190  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  74.59 
 
 		 124 aa  189  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  72.95 
 
 		 122 aa  189  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  74.59 
 
 		 122 aa  189  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  73.77 
 
 		 123 aa  187  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 122 aa  186  9e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  75.41 
 
 		 125 aa  186  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 		 123 aa  185  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  70.49 
 
 		 122 aa  182  9e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  68.03 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  70.49 
 
 		 123 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 122 aa  180  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 123 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 		 126 aa  180  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  72.95 
 
 		 121 aa  180  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 		 121 aa  179  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 		 121 aa  179  9.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 		 121 aa  179  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 121 aa  179  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  70.49 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  70.49 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 122 aa  178  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 124 aa  177  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  70.49 
 
 		 121 aa  177  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 124 aa  177  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  72.03 
 
 		 122 aa  176  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  176  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  68.6 
 
 		 121 aa  177  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  75.22 
 
 		 127 aa  176  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  71.07 
 
 		 127 aa  176  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  176  9e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 125 aa  175  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 123 aa  176  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 126 aa  175  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 121 aa  175  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1452  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0642708  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  73.45 
 
 		 128 aa  175  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 124 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 124 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 124 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  66.94 
 
 		 123 aa  174  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  72.17 
 
 		 128 aa  174  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  72.17 
 
 		 128 aa  174  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1354  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0146999  normal  0.399807 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 122 aa  174  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1174  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  173  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119406  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  173  6e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  173  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 124 aa  173  6e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 122 aa  173  8e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  173  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 124 aa  173  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1978  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.234  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 121 aa  172  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 121 aa  172  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 125 aa  172  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29480  SSU ribosomal protein S13P  63.93 
 
 		 124 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0570342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13497  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 124 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000125579  normal  0.574035 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2317  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1656  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819734  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  70.49 
 
 		 123 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 123 aa  171  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1737  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  170  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3162  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 122 aa  170  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548712  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0383  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  170  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.087289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1636  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 122 aa  170  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556196  normal  0.0187712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3644  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 122 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.17106  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 126 aa  170  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 126 aa  170  7.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 121 aa  169  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 121 aa  169  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3426  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  169  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.968346  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  65.85 
 
 		 127 aa  169  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1386  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0720  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.401773  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0782  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.630132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 126 aa  167  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 124 aa  168  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 124 aa  167  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>