More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0647 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  100 
 
 
222 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  68.22 
 
 
217 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  63.21 
 
 
217 aa  285  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  62.5 
 
 
214 aa  266  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  62.98 
 
 
214 aa  266  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  59.13 
 
 
216 aa  254  7e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  55.4 
 
 
213 aa  252  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  58.65 
 
 
214 aa  250  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  54.25 
 
 
216 aa  244  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  54.81 
 
 
214 aa  241  9e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  54.72 
 
 
217 aa  239  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  52.36 
 
 
217 aa  238  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  53.77 
 
 
220 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  56.77 
 
 
215 aa  234  7e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  54.15 
 
 
217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  50.93 
 
 
219 aa  229  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  52.88 
 
 
214 aa  229  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  50.47 
 
 
216 aa  228  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  53.66 
 
 
219 aa  227  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  227  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  227  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  50.47 
 
 
216 aa  227  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  51.44 
 
 
213 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  226  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  226  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  51.63 
 
 
214 aa  226  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  51.42 
 
 
217 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  48.6 
 
 
215 aa  226  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  49.53 
 
 
216 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  52.68 
 
 
217 aa  224  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  49.06 
 
 
215 aa  224  8e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  48.6 
 
 
216 aa  224  8e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  48.6 
 
 
216 aa  224  8e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  49.06 
 
 
215 aa  224  8e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  53.17 
 
 
217 aa  223  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  52.4 
 
 
213 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  49.53 
 
 
215 aa  223  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  48.6 
 
 
216 aa  221  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  48.58 
 
 
215 aa  221  7e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  53.17 
 
 
217 aa  220  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5879  adenylate kinase  49.77 
 
 
220 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276122  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  51.92 
 
 
217 aa  220  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  50.7 
 
 
219 aa  220  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2277  adenylate kinase  48.86 
 
 
220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000360285  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0924  adenylate kinase  48.86 
 
 
220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123931  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1080  adenylate kinase  48.86 
 
 
220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0446063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0927  adenylate kinase  48.86 
 
 
220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0572  adenylate kinase  48.86 
 
 
220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148537  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0748  adenylate kinase  49.31 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2154  adenylate kinase  48.86 
 
 
220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1049  adenylate kinase  48.86 
 
 
220 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000082609  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  52.2 
 
 
217 aa  218  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  50.47 
 
 
217 aa  218  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0739  adenylate kinase  49.3 
 
 
220 aa  218  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139033  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1936  adenylate kinase  48.85 
 
 
220 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0745182  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2548  adenylate kinase  48.85 
 
 
220 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2572  adenylate kinase  48.85 
 
 
220 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601307 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  49.76 
 
 
211 aa  216  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2466  adenylate kinase  48.85 
 
 
220 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041386 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  47.91 
 
 
217 aa  216  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2596  adenylate kinase  48.85 
 
 
220 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  51.4 
 
 
224 aa  215  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01105  adenylate kinase  51.17 
 
 
214 aa  215  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  50.23 
 
 
208 aa  214  9e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  49.3 
 
 
217 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  50.48 
 
 
215 aa  213  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  49.07 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  50 
 
 
218 aa  213  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  46.7 
 
 
214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  46.48 
 
 
217 aa  211  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  48.6 
 
 
216 aa  211  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  48.82 
 
 
229 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1112  adenylate kinase  48.33 
 
 
209 aa  210  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2066  adenylate kinase  49.77 
 
 
214 aa  210  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  49.77 
 
 
229 aa  210  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  48.82 
 
 
217 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  51.46 
 
 
216 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  50 
 
 
215 aa  210  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1528  adenylate kinase  48.17 
 
 
227 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01328  adenylate kinase  49.54 
 
 
214 aa  209  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  49.52 
 
 
423 aa  209  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2952  adenylate kinase  47.66 
 
 
218 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  49.76 
 
 
229 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  48.84 
 
 
216 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0281  adenylate kinase  47.27 
 
 
221 aa  208  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  45.37 
 
 
216 aa  208  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  49.3 
 
 
227 aa  208  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2380  adenylate kinase  47.2 
 
 
215 aa  208  6e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000961521  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  50.23 
 
 
216 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004136  adenylate kinase  49.08 
 
 
214 aa  208  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2847  adenylate kinase  49.3 
 
 
214 aa  207  8e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000688641  decreased coverage  0.00000000215669 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1430  adenylate kinase  47.93 
 
 
214 aa  207  9e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000051006  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1315  adenylate kinase  50.47 
 
 
214 aa  207  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0119239  normal  0.109595 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  48.84 
 
 
217 aa  206  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0535  adenylate kinase  48.61 
 
 
221 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>