More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0640 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  100 
 
 		 132 aa  265  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  87.88 
 
 		 132 aa  242  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  82.58 
 
 		 132 aa  229  9e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  82.58 
 
 		 132 aa  229  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  82.58 
 
 		 132 aa  228  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  76.52 
 
 		 132 aa  221  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  74.24 
 
 		 132 aa  212  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0715  30S ribosomal protein S8  65.15 
 
 		 132 aa  189  9e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000123217  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  62.31 
 
 		 134 aa  173  7e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  61.54 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  168  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  62.12 
 
 		 131 aa  167  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  166  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  56.06 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  59.85 
 
 		 132 aa  163  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  59.85 
 
 		 132 aa  163  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 131 aa  163  9e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  161  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  58.33 
 
 		 132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  55.38 
 
 		 131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  160  5.0000000000000005e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  160  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  59.09 
 
 		 132 aa  160  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 132 aa  160  6e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  159  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  159  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  159  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  159  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  159  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  159  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  159  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  159  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  159  9e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  159  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  59.85 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 132 aa  159  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  158  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 132 aa  157  3e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1306  30S ribosomal protein S8  59.09 
 
 		 134 aa  157  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000833036  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1380  30S ribosomal protein S8  59.09 
 
 		 134 aa  157  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00507298  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  53.73 
 
 		 136 aa  157  6e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 134 aa  154  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0967  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0820886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0472  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  56.92 
 
 		 131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0722  ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  154  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 134 aa  152  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0844  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0973  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 		 130 aa  151  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000165521  hitchhiker  0.000000973471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0640  ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 130 aa  150  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000305932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4534  30S ribosomal protein S8  56.06 
 
 		 130 aa  150  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000327382  normal  0.123392 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 131 aa  150  8e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  50.77 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5065  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000451262  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0597  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101428  normal  0.901503 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0297  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000747182  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  57.25 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3900  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000634775  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0781  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00525969  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03157  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000452809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0407  ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000058536  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0407  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000202289  hitchhiker  0.00000218378 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3730  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0711258  normal  0.0251967 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3601  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000126765  normal  0.0104758 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3622  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000167775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4676  30S ribosomal protein S8  54.2 
 
 		 130 aa  147  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000540573  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3793  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.114774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4629  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000277802  normal  0.781469 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3695  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.068441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3789  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000933012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3691  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000772145  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03108  hypothetical protein  55.73 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000188552  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3622  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0133012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3500  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 130 aa  146  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000345465  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0733  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 		 130 aa  146  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00108537  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3987  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0073999  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3808  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000417355  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3895  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000590966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3991  ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246659  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  50.38 
 
 		 133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4229  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00128443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>