39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0532 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2939  outer membrane porin FmdC, putative  77.35 
 
 		 406 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0532  phosphate-selective porin O and P  100 
 
 		 415 aa  854    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000620522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0451  phosphate-selective porin O and P  69.4 
 
 		 401 aa  595  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0445  phosphate-selective porin O and P  68.92 
 
 		 401 aa  593  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1204  phosphate-selective porin O and P  67.48 
 
 		 403 aa  567  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755858  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4122  phosphate-selective porin O and P  63.86 
 
 		 399 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.556284 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4031  phosphate-selective porin O and P  62.83 
 
 		 400 aa  537  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.364483  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0072  phosphate-selective porin O and P  40.32 
 
 		 396 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1175  outer membrane porin FmdC, putative  33.47 
 
 		 489 aa  196  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000392921  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1417  hypothetical protein  24.61 
 
 		 367 aa  89  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0983  hypothetical protein  28.19 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.686958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2000  hypothetical protein  26.23 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1253  hypothetical protein  26.09 
 
 		 455 aa  69.7  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00910104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0073  phosphate-selective porin O and P  24.57 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0510  phosphate-selective porin O and P  24.94 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000442371  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5810  hypothetical protein  27.54 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00960319 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0462  hypothetical protein  23.64 
 
 		 530 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.369233  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0939  hypothetical protein  21.36 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000462454  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0508  hypothetical protein  28.21 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.118287  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0157  hypothetical protein  23.72 
 
 		 382 aa  57  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0272  hypothetical protein  24.38 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1473  hypothetical protein  23.75 
 
 		 494 aa  54.7  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00085768  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4013  phosphate-selective porin O and P  35.4 
 
 		 502 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4382  phosphate-selective porin O and P  35.4 
 
 		 502 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4458  hypothetical protein  24.03 
 
 		 458 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0056  hypothetical protein  22.71 
 
 		 459 aa  53.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000444943  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4495  phosphate-selective porin O and P  34.75 
 
 		 554 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2588  phosphate-selective porin O and P  31.9 
 
 		 480 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0801  phosphate-selective porin O and P  31.78 
 
 		 473 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.167579  normal  0.676096 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1055  hypothetical protein  24.7 
 
 		 465 aa  50.4  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114803  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0947  hypothetical protein  28.97 
 
 		 512 aa  50.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0542  phosphate-selective porin O and P  26.32 
 
 		 431 aa  50.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.63282  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1382  hypothetical protein  25.71 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0246633 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2169  phosphate-selective porin O and P  32.41 
 
 		 475 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1778  hypothetical protein  26.21 
 
 		 216 aa  47.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000267624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03751  phosphate-selective porin O and P  30.84 
 
 		 292 aa  47.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4128  phosphate-selective porin O and P  23.17 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.611373 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0352  hypothetical protein  21.99 
 
 		 448 aa  43.9  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000257502  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3817  hypothetical protein  29.75 
 
 		 417 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40182 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>