More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0502 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0502  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.773661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2976  DedA family protein  84.34 
 
 		 198 aa  348  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0707  hypothetical protein  76.26 
 
 		 210 aa  318  5e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0282  DedA family protein  69.7 
 
 		 202 aa  291  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0625  SNARE associated Golgi protein  73.89 
 
 		 203 aa  286  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.21493e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0611  SNARE associated Golgi protein  73.1 
 
 		 208 aa  282  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0339  SNARE associated Golgi protein  64.14 
 
 		 206 aa  237  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000282866  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  52.5 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  53.03 
 
 		 201 aa  207  8e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  52.76 
 
 		 199 aa  201  9e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0819  DedA family protein  47.76 
 
 		 202 aa  192  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  49.5 
 
 		 203 aa  191  9e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  48.99 
 
 		 202 aa  184  6e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1302  DedA family protein  49.74 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262932  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1183  DedA family protein  52.87 
 
 		 200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1078  DedA family protein  45.45 
 
 		 195 aa  180  1e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  43.94 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  40.1 
 
 		 208 aa  164  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  41.84 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1836  SNARE associated Golgi protein  42.68 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  39 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2053  SNARE associated Golgi protein  37.39 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  39.68 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  38.38 
 
 		 202 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0665  SNARE associated Golgi protein  40.91 
 
 		 212 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  39.18 
 
 		 205 aa  144  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3743  SNARE associated Golgi protein  38.46 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362202  normal  0.890971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0454  hypothetical protein  35.24 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_002950  PG1952  DedA family protein  40.38 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.23 
 
 		 203 aa  142  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  39.52 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1404  SNARE associated Golgi protein  40.31 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1303  SNARE associated Golgi protein  40.31 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280885  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2546  hypothetical protein  39.79 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0191  alkaline phosphatase  37.19 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1053  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.71 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2737  SNARE associated Golgi protein  41.18 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.388255  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4718  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.06 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.517829  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2291  SNARE associated Golgi protein  34.65 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1349  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.12 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3867  DedA family protein  36.13 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1959  hypothetical protein  33.17 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0902  dedA family protein  35.78 
 
 		 201 aa  128  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4471  dedA family protein  35.78 
 
 		 201 aa  128  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.238489 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2066  hypothetical protein  41.28 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.11 
 
 		 231 aa  128  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9346  alkaline phosphatase  36.87 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.965489  normal  0.785405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2364  hypothetical protein  38.61 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000112613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0722  SNARE associated Golgi protein  34.47 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0975  dedA family protein  32.84 
 
 		 201 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  34.33 
 
 		 213 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1081  putative alkaline phosphatase  37.77 
 
 		 198 aa  125  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0514  alkaline phosphatase  34.86 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2135  DedA family protein  33.66 
 
 		 202 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1977  SNARE associated Golgi protein  38 
 
 		 201 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.669435 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0773  DedA family protein  38.55 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000448539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0708  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  38.55 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0751539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0865  dedA family protein  38.55 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0810  DedA family protein  38.55 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.621407  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0619  hypothetical protein  39.64 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.512378  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2342  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.05 
 
 		 228 aa  122  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1043  SNARE associated Golgi protein  37.99 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0721  dedA family protein; alkaline phosphatase-like protein  38.89 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.223536  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1693  SNARE associated Golgi protein  34.33 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0906  dedA family protein  38.89 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.29745e-42 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0291  SNARE associated Golgi protein  38.15 
 
 		 239 aa  121  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.702057  normal  0.0958134 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0095  DedA family protein  34.88 
 
 		 205 aa  121  9e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2080  hypothetical protein  36.46 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0320169  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2561  hypothetical protein  30.35 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1027  SNARE associated Golgi protein  36.99 
 
 		 325 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0105  SNARE associated Golgi protein  32.2 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2381  SNARE associated Golgi protein  33.5 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  35.08 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5727  SNARE associated Golgi protein-related protein  36.54 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0234  SNARE associated Golgi protein  43.87 
 
 		 178 aa  115  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25760  uncharacterized membrane-associated protein  32.39 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  32.02 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0759  SNARE associated Golgi protein  39.41 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.259781  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0082  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.74 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06150  uncharacterized membrane-associated protein  36.36 
 
 		 205 aa  111  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.430266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2080  dedA family protein  33.86 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1970  hypothetical protein  36.2 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1901  dedA family protein  33.33 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.351211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1864  DedA family integral membrane protein  33.33 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0968517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1854  DedA family integral membrane protein  33.33 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.359684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2048  DedA family protein  33.33 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2038  dedA family protein  33.33 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  29.06 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  31.22 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  31.22 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  31.22 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3271  dedA family protein  33.33 
 
 		 200 aa  108  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  31.22 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  31.22 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0057  alkaline phosphatase like protein  34.12 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0483626  hitchhiker  0.00000117914 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5192  alkaline phosphatase like protein  34.12 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0400654  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  31.22 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1046  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.69 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2117  dedA family protein  33.33 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.403249  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0130  hypothetical protein  32.5 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>