More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0483 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0483  precorrin-4 C11-methyltransferase  100 
 
 		 258 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2994  precorrin-4 C11-methyltransferase  88.28 
 
 		 264 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0039  precorrin-4 C11-methyltransferase  85.99 
 
 		 258 aa  441  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3541  precorrin-4 C11-methyltransferase  83.53 
 
 		 261 aa  411  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3607  precorrin-4 C11-methyltransferase  83.14 
 
 		 261 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3231  precorrin-4 C11-methyltransferase  69.6 
 
 		 258 aa  350  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00900029  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2129  precorrin-4 C11-methyltransferase  61.26 
 
 		 259 aa  296  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1298  precorrin-4 C11-methyltransferase  57.14 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1236  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.54 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1430  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.54 
 
 		 251 aa  275  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0323621  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0313  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.59 
 
 		 251 aa  275  8e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1092  precorrin-4 C11-methyltransferase  56.8 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1013  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.37 
 
 		 253 aa  265  5.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0614  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.38 
 
 		 249 aa  264  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00328163  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1294  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.99 
 
 		 248 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.04031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2711  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.57 
 
 		 248 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  51 
 
 		 254 aa  257  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.23833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1747  precorrin-4 C11-methyltransferase  51 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.129763  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0962  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.19 
 
 		 254 aa  255  5e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.6045  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1716  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.39 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1342  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.4 
 
 		 254 aa  251  7e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1011  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.6 
 
 		 254 aa  251  7e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.04114  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0933  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.81 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2205  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.19 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21210  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.19 
 
 		 867 aa  245  4.9999999999999997e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1265  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.97 
 
 		 267 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1272  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.43 
 
 		 251 aa  245  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2364  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.79 
 
 		 257 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2198  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.79 
 
 		 257 aa  244  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.333099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2251  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.59 
 
 		 257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  0.353064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1376  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.2 
 
 		 252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2151  precorrin-4 C11-methyltransferase  51 
 
 		 257 aa  242  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0163963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0571  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.33 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0473  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.19 
 
 		 252 aa  241  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0702  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.83 
 
 		 244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0059  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.24 
 
 		 256 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0638  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.76 
 
 		 271 aa  235  6e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0934  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.24 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3650  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.59 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.796321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4477  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.64 
 
 		 610 aa  232  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00717843  normal  0.120162 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2609  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.01 
 
 		 257 aa  224  9e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2087  precorrin-3 methylase  48.81 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1557  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.88 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0114  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.06 
 
 		 262 aa  222  4e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177043  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1014  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.4 
 
 		 626 aa  222  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12107  precorrin-4 C11-methyltransferase cobM  51.24 
 
 		 251 aa  222  6e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.182153  normal  0.885771 
 
 
-
 
NC_002950  PG0211  cobalamin biosynthesis protein CbiG/precorrin-4 C11-methyltransferase  46.4 
 
 		 614 aa  221  8e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1288  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.22 
 
 		 626 aa  221  9.999999999999999e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3384  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.59 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215023  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2521  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.39 
 
 		 250 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2484  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.39 
 
 		 250 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2529  precorrin-4 C11-methyltransferase  49.39 
 
 		 250 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.527305 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0640  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.43 
 
 		 257 aa  218  8.999999999999998e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.194872  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1521  precorrin-4 C11-methyltransferase  50 
 
 		 261 aa  217  1e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000101409 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1853  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.85 
 
 		 247 aa  217  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2501  precorrin-4 C11-methyltransferase  53.04 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.218572 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1375  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.41 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0801  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.08 
 
 		 266 aa  215  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3136  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.39 
 
 		 272 aa  214  8e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1024  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.06 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.249462  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2213  precorrin-3 methylase  50 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6035  precorrin-4 C11-methyltransferase  42.8 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2300  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.81 
 
 		 273 aa  211  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366203  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3139  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.44 
 
 		 243 aa  211  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25920  precorrin-3 methylase  50 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297541  normal  0.071417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3737  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.81 
 
 		 275 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1885  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.45 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1262  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.06 
 
 		 252 aa  209  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0050  precorrin-4 C11-methyltransferase  44.84 
 
 		 255 aa  209  5e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0620  precorrin-4 C11-methyltransferase protein  48.22 
 
 		 271 aa  208  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.263132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1177  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.21 
 
 		 305 aa  208  8e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1351  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.62 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2163  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.03 
 
 		 274 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0994  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  46.67 
 
 		 299 aa  206  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1578  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.64 
 
 		 242 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1300  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.67 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3278  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.25 
 
 		 253 aa  205  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1596  precorrin-4 C11-methyltransferase  52.05 
 
 		 242 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.727098  normal  0.416998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.27 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25946  normal  0.0736251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2446  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.45 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130726  normal  0.124304 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3103  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.8 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2530  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.83 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855327 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0559  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.21 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1872  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  46.89 
 
 		 287 aa  203  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1564  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.05 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253118  normal  0.214845 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7180  precorrin-4 C11-methyltransferase  45.42 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987588  normal  0.0970048 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2358  precorrin-4 C11-methyltransferase / cobalt-factor II C20-methyltransferase  47.48 
 
 		 243 aa  203  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1249  precorrin-4 C11-methyltransferase / precorrin-2 C20-methyltransferase  48.97 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2779  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.43 
 
 		 250 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1198  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.41 
 
 		 242 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1678  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.41 
 
 		 242 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0635313  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2352  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.27 
 
 		 250 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4829  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.41 
 
 		 242 aa  201  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0449828 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3211  precorrin-4 C11-methyltransferase  47.13 
 
 		 238 aa  201  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1651  precorrin-4 C11-methyltransferase  51.05 
 
 		 242 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3410  precorrin-4 C11-methyltransferase  46.27 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.231837 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5685  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.41 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1523  precorrin-4 C11-methyltransferase  50.41 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00837984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1721  Precorrin-4 C(11)-methyltransferase  47.93 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5365  precorrin-4 C11-methyltransferase  48.97 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.973627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>