194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0477 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0477  precorrin-8X methylmutase  100 
 
 		 214 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2999  precorrin-8X methylmutase  79.72 
 
 		 213 aa  346  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0033  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  79.25 
 
 		 213 aa  341  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3545  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  70.89 
 
 		 214 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3611  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  70.62 
 
 		 216 aa  304  6e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  65.07 
 
 		 214 aa  254  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1298  precorrin-8X methylmutase  69.86 
 
 		 211 aa  250  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000022919  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2613  Precorrin-8X methylmutase  51.03 
 
 		 215 aa  205  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  50 
 
 		 215 aa  204  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1298  Precorrin-8X methylmutase  47.8 
 
 		 207 aa  191  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2161  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  52.17 
 
 		 228 aa  190  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2136  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  53.96 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0350382 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0080  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.19 
 
 		 213 aa  187  7e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.52758 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  52.8 
 
 		 213 aa  184  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1382  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.93 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1022  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  51.69 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535258  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1285  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  48.06 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.808372  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2298  precorrin-8X methylmutase  50.53 
 
 		 219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2777  precorrin-8X methylmutase  50.24 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.066759 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1008  Precorrin-8X methylmutase  45.93 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3739  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  50.72 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1691  precorrin-8X methylmutase  46.38 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3654  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.95 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  47.85 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  47.85 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.6 
 
 		 205 aa  175  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0070  precorrin-8X methylmutase  49.74 
 
 		 239 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.54 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2081  precorrin-8X methylmutase  45.24 
 
 		 218 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  43.13 
 
 		 225 aa  168  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1720  cobalt-precorrin-8X methylmutase  43.2 
 
 		 227 aa  168  5e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0440  precorrin-8X methylmutase, precorrin isomerase  48.83 
 
 		 225 aa  167  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.46496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0475  precorrin-8X methylmutase  48.83 
 
 		 225 aa  167  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03744  putative transmembrane protein  49.04 
 
 		 534 aa  165  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1303  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.08 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21130  precorrin-8X methylmutase  49.29 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3134  precorrin-8X methylmutase  42.86 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  48.26 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  44.17 
 
 		 207 aa  158  7e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1477  precorrin-8X methylmutase  41.18 
 
 		 201 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  43.13 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5060  precorrin-8X methylmutase  41.18 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341493 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1504  precorrin-8X methylmutase  41.18 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.88 
 
 		 541 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  47.57 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0645  precorrin-8X methylmutase  48.17 
 
 		 199 aa  147  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000995367  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4475  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.69 
 
 		 451 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253543  normal  0.0484497 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2360  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43 
 
 		 520 aa  145  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0292  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  47.37 
 
 		 213 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0567  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.97 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  45.59 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2202  cobalt-precorrin-8X methylmutase  48.36 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2255  cobalt-precorrin-8X methylmutase  47.89 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.463985 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2155  cobalt-precorrin-8X methylmutase  47.89 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0927  Precorrin-8X methylmutase  44.88 
 
 		 204 aa  141  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000290763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1287  precorrin-8X methylmutase  41.79 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2368  cobalt-precorrin-8X methylmutase  47.42 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2209  cobalt-precorrin-8X methylmutase  47.42 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.185251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0642  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.54 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0213  precorrin-3 methylase/precorrin-8X methylmutase  42.72 
 
 		 468 aa  139  3.9999999999999997e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2253  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  44.76 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1349  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  41.97 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1290  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.78 
 
 		 469 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.954659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  43.86 
 
 		 220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  41.29 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1341  precorrin-8X methylmutase  34.63 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0027  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.84 
 
 		 230 aa  128  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.615155  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1012  precorrin-3B C17-methyltransferase  40.28 
 
 		 472 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0621  precorrin-8X methylmutase  39.13 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.517297  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1332  precorrin-8X methylmutase  39.57 
 
 		 212 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0538013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1343  precorrin-8X methylmutase  38.38 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212659  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  41.62 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  40.7 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0015  precorrin-8X methylmutase  36.23 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  40.91 
 
 		 209 aa  121  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6032  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.21 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  39.09 
 
 		 210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2700  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  46.28 
 
 		 196 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143987  hitchhiker  0.0000899582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  41.12 
 
 		 230 aa  117  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  42 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2518  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  45.74 
 
 		 196 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1852  precorrin-8X methylmutase  39.89 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.334862  normal  0.809538 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3745  precorrin-8X methylmutase  38.35 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.106474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  40.91 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3284  precorrin-8X methylmutase  42.13 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174863  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  39.5 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2534  precorrin-8X methylmutase  40.4 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4511  precorrin-8X methylmutase  37.5 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288087 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2399  precorrin-8X methylmutase  44.06 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154427  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  39.7 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0476  precorrin-8X methylmutase  38.83 
 
 		 206 aa  111  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0933349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  39.2 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  39.7 
 
 		 208 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1670  precorrin-8X methylmutase  40.21 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  41.27 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  39.2 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4572  precorrin-8X methylmutase  42.08 
 
 		 208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1911  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.92 
 
 		 209 aa  109  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1625  Precorrin-8X methylmutase  38.89 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  38.19 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>