More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0439 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  100 
 
 
294 aa  593  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  65.99 
 
 
298 aa  420  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  65.77 
 
 
298 aa  353  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  34.53 
 
 
306 aa  182  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  34.2 
 
 
306 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  35 
 
 
297 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  31.33 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  30.03 
 
 
309 aa  159  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  29.84 
 
 
315 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  30.96 
 
 
302 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  30.69 
 
 
297 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  30.54 
 
 
295 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  30.03 
 
 
292 aa  148  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  29.47 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  32.62 
 
 
305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  31.77 
 
 
298 aa  139  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  25.99 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  27.76 
 
 
296 aa  133  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  31.31 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  32.9 
 
 
305 aa  129  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  31.8 
 
 
303 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  29.47 
 
 
300 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  28.52 
 
 
310 aa  123  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  26.07 
 
 
298 aa  122  8e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  27.72 
 
 
301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  28.09 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  24.09 
 
 
328 aa  119  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  28.33 
 
 
296 aa  119  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  28.66 
 
 
327 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  28.1 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1621  flagellar hook-associated protein 3  28.95 
 
 
302 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  26.62 
 
 
292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  28.66 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  26.62 
 
 
287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1759  flagellar hook-associated protein FlgL  25.6 
 
 
287 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1815  flagellar hook-associated protein FlgL  25.6 
 
 
287 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2931  flagellin-like  31.25 
 
 
295 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.763262  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  29.02 
 
 
317 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1705  flagellar hook-associated protein FlgL  25.6 
 
 
287 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  26.97 
 
 
297 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  29.02 
 
 
317 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  27.36 
 
 
305 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  28.67 
 
 
317 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  28.32 
 
 
317 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  28.67 
 
 
317 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  28.67 
 
 
317 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1527  flagellar hook-associated protein FlgL  24.57 
 
 
287 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00165478  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  28.32 
 
 
317 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  28.67 
 
 
317 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1737  flagellar hook-associated protein FlgL  24.57 
 
 
287 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1516  flagellar hook-associated protein FlgL  24.57 
 
 
287 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3641  flagellar hook-associated protein FlgL  24.91 
 
 
287 aa  101  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0671  flagellar hook-associated protein 3  25.96 
 
 
305 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0367286 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1556  flagellar hook-associated protein FlgL  24.57 
 
 
287 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416222  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  24.92 
 
 
304 aa  100  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  25.72 
 
 
302 aa  99  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  24.44 
 
 
304 aa  99  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  26.49 
 
 
299 aa  98.2  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  27.05 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  27.22 
 
 
326 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  27.05 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  27.05 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  25.83 
 
 
299 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  27.05 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  27.05 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1563  flagellar hook-associated protein 3  30.33 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0390  flagellar hook-associated protein 3  25.97 
 
 
294 aa  96.3  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2610  flagellar hook-associated protein 3  29.93 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00831645  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  26.78 
 
 
326 aa  92.4  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  26.78 
 
 
326 aa  92.4  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2514  flagellar hook-associated protein 3  29.59 
 
 
294 aa  92.4  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0170039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  26.79 
 
 
870 aa  90.1  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  27.92 
 
 
305 aa  89.7  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  25.86 
 
 
317 aa  89.4  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  28.18 
 
 
420 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1343  flagellar hook-associated protein FlgL  29.93 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0130628  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  26.37 
 
 
305 aa  87  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0216  flagellar hook-associated protein FlgL  25.08 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  33.33 
 
 
594 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  31.72 
 
 
504 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  27.65 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  33.13 
 
 
410 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1019  flagellar hook-associated protein 3  27.47 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2525  flagellar hook-associated protein 3  30.18 
 
 
507 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0307  flagellar hook-associated protein 3  32.48 
 
 
514 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  25.73 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2435  flagellar hook-associated protein 3  28.97 
 
 
438 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1552  flagellar hook-associated protein  25.35 
 
 
207 aa  79  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  25.69 
 
 
317 aa  79  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3458  flagellar hook-associated protein 3  25.96 
 
 
305 aa  79  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  26.54 
 
 
305 aa  79  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2562  flagellin domain protein  21.78 
 
 
325 aa  77  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1878  flagellar hook-associated protein FlgL  26.32 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2917  flagellin-like protein  24.57 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  31.67 
 
 
408 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0273  lateral flagellar hook associated protein 3  23.72 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.462118  normal  0.382201 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  26.05 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  27.84 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1261  flagellin domain-containing protein  27.41 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424073  normal  0.51909 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  26.41 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>