266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0438 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  71.7 
 
 		 477 aa  717    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  100 
 
 		 477 aa  956    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  66.11 
 
 		 478 aa  641    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  42.3 
 
 		 465 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  40.12 
 
 		 456 aa  326  5e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3755  flagellar hook-associated protein FlgK  41.61 
 
 		 482 aa  323  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3839  flagellar hook-associated protein FlgK  41.2 
 
 		 480 aa  302  9e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0049763 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  35.55 
 
 		 464 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  33.06 
 
 		 471 aa  237  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  32.99 
 
 		 480 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  31.48 
 
 		 486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  29.89 
 
 		 525 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  29.04 
 
 		 531 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  30.85 
 
 		 458 aa  194  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  30.58 
 
 		 464 aa  187  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  27.72 
 
 		 541 aa  183  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  28.11 
 
 		 489 aa  177  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  30.67 
 
 		 463 aa  169  9e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  33.42 
 
 		 683 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  29.92 
 
 		 454 aa  168  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  33.15 
 
 		 682 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  29.24 
 
 		 475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  30.69 
 
 		 457 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  33.51 
 
 		 647 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  27.73 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  29.13 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  29.75 
 
 		 457 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  29.98 
 
 		 459 aa  160  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  34.4 
 
 		 638 aa  160  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  34.6 
 
 		 652 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  29.83 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  31.01 
 
 		 547 aa  156  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1344  flagellar hook-associated protein  30.56 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0451355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  31.62 
 
 		 547 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  31.35 
 
 		 547 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  31.35 
 
 		 547 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  31.35 
 
 		 547 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  30.67 
 
 		 547 aa  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  31 
 
 		 682 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  29.79 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  30.3 
 
 		 838 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  29.71 
 
 		 858 aa  154  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  31.35 
 
 		 547 aa  153  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  29.71 
 
 		 858 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  29.07 
 
 		 482 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  28.16 
 
 		 443 aa  153  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  34.1 
 
 		 637 aa  153  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  31.3 
 
 		 547 aa  153  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  31.3 
 
 		 547 aa  153  8e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  27.53 
 
 		 463 aa  152  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  32.84 
 
 		 560 aa  150  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  31.65 
 
 		 549 aa  149  8e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  33.13 
 
 		 681 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  31.15 
 
 		 554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  31.15 
 
 		 554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  31.15 
 
 		 554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  31.97 
 
 		 539 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  31.51 
 
 		 548 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  28.51 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  33.43 
 
 		 688 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  31 
 
 		 546 aa  145  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2513  flagellar hook-associated protein FlgK  29.41 
 
 		 469 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00819132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  28.55 
 
 		 537 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  26.88 
 
 		 457 aa  144  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  33.53 
 
 		 681 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  27.98 
 
 		 637 aa  144  5e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2243  flagellar hook-associated protein FlgK  27.38 
 
 		 519 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2609  flagellar hook-associated protein FlgK  29.85 
 
 		 469 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0376926  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  30.42 
 
 		 676 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  31.06 
 
 		 624 aa  140  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  31.06 
 
 		 624 aa  140  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  30.94 
 
 		 642 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  33.94 
 
 		 645 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  33.94 
 
 		 645 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  32.23 
 
 		 629 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  28.86 
 
 		 614 aa  138  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  32.59 
 
 		 680 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  31.89 
 
 		 697 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  30.71 
 
 		 553 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  30.71 
 
 		 553 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  30.71 
 
 		 553 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  30.71 
 
 		 553 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  30.71 
 
 		 553 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  32.59 
 
 		 680 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  31.94 
 
 		 631 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  26.69 
 
 		 623 aa  135  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  25.47 
 
 		 458 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  34.94 
 
 		 702 aa  134  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  26.44 
 
 		 627 aa  133  6e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  31.34 
 
 		 570 aa  133  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  34 
 
 		 698 aa  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  25.47 
 
 		 458 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  27.81 
 
 		 847 aa  133  7.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  30.52 
 
 		 696 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  30.09 
 
 		 920 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  31.12 
 
 		 541 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  27.39 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  28.18 
 
 		 568 aa  131  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  31.68 
 
 		 653 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2445  flagellar hook-associated protein  25.8 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>