257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0392 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  286  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  78.77 
 
 
146 aa  233  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  71.72 
 
 
147 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  62.76 
 
 
147 aa  181  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  62.07 
 
 
147 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  50.34 
 
 
148 aa  147  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  48.97 
 
 
148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  48.97 
 
 
148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  46.9 
 
 
148 aa  142  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  48.97 
 
 
149 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  49.65 
 
 
147 aa  141  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  49.66 
 
 
149 aa  140  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  50.34 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  53.1 
 
 
148 aa  138  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0756  GatB/YqeY  46.9 
 
 
149 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.938432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  46.9 
 
 
149 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0719  hypothetical protein  46.9 
 
 
149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502597  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  51.03 
 
 
152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  51.03 
 
 
147 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  44.76 
 
 
148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  49.66 
 
 
147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  47.59 
 
 
149 aa  134  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  45.77 
 
 
149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  50.34 
 
 
147 aa  133  7.000000000000001e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  46.9 
 
 
152 aa  133  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  40.69 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  45.52 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  47.59 
 
 
149 aa  131  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  43.66 
 
 
149 aa  131  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  46.9 
 
 
147 aa  131  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  47.59 
 
 
147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  46.58 
 
 
149 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  46.21 
 
 
148 aa  130  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  46.21 
 
 
147 aa  130  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  46.53 
 
 
152 aa  130  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  46.21 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  46.21 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  46.21 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  46.21 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  47.59 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  46.21 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  46.21 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  46.21 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  46.21 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  45.89 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0194  GatB/YqeY domain-containing protein  45.58 
 
 
151 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  42.28 
 
 
152 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  45.52 
 
 
147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  44.83 
 
 
147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  48.97 
 
 
148 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  48.97 
 
 
148 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  48.97 
 
 
148 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  48.97 
 
 
148 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  48.97 
 
 
148 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  48.97 
 
 
148 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  48.97 
 
 
148 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  49.25 
 
 
149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  45.95 
 
 
513 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  43.45 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  43.45 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  44.14 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  43.45 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  47.41 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  42.76 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  45.07 
 
 
149 aa  125  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  40.27 
 
 
151 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  46.21 
 
 
147 aa  124  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  45.83 
 
 
148 aa  124  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1932  hypothetical protein  47.22 
 
 
149 aa  123  8.000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.467082  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  45.14 
 
 
147 aa  123  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  45.83 
 
 
147 aa  122  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  43.45 
 
 
150 aa  122  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3943  hypothetical protein  48.97 
 
 
148 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  42.76 
 
 
149 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  44.44 
 
 
147 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  44.97 
 
 
150 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  44.83 
 
 
151 aa  120  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  47.22 
 
 
148 aa  120  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0886  hypothetical protein  48.28 
 
 
148 aa  120  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.735291  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  42.67 
 
 
152 aa  120  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  44 
 
 
153 aa  120  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0729  GatB/Yqey domain-containing protein  42.07 
 
 
148 aa  120  7e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235236  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  43.75 
 
 
147 aa  120  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  42 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1214  GatB/Yqey domain-containing protein  45.99 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  46.21 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2992  GatB/Yqey domain-containing protein  46.21 
 
 
152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0590  GatB/YqeY  42 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.21296  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  42 
 
 
152 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0721  hypothetical protein  42.76 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  44.97 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  43.75 
 
 
147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07550  hypothetical protein  42.76 
 
 
149 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  41.33 
 
 
153 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2460  GatB/YqeY domain-containing protein  44.83 
 
 
148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.059137  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  42.67 
 
 
154 aa  117  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  44.83 
 
 
147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  44.83 
 
 
148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  42.95 
 
 
152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.932547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>