65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0379 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0379  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  630  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0386934  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3105  hypothetical protein  87.7 
 
 
317 aa  548  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.837646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4062  hypothetical protein  82.45 
 
 
304 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3710  protein of unknown function DUF1385  78 
 
 
301 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.010982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3805  protein of unknown function DUF1385  77.33 
 
 
301 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1028  protein of unknown function DUF1385  76.8 
 
 
307 aa  491  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0122365  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2648  hypothetical protein  74.27 
 
 
308 aa  463  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267473  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0063  protein of unknown function DUF1385  55.79 
 
 
291 aa  292  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000382  hitchhiker  0.00259146 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2155  hypothetical protein  50 
 
 
308 aa  292  5e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000573761  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3171  hypothetical protein  53.68 
 
 
292 aa  291  8e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000104727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4473  hypothetical protein  49.53 
 
 
327 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0092  hypothetical protein  44.12 
 
 
308 aa  272  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0158548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2873  protein of unknown function DUF1385  48.46 
 
 
295 aa  271  9e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000122593  hitchhiker  0.0000000114155 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2398  hypothetical protein  48.31 
 
 
302 aa  270  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000248355  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0804  protein of unknown function DUF1385  45.1 
 
 
294 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000749305  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1110  hypothetical protein  48.5 
 
 
307 aa  247  2e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000475051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2398  hypothetical protein  51.2 
 
 
318 aa  246  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.625274 
 
 
-
 
NC_002936  DET1328  hypothetical protein  47.84 
 
 
307 aa  246  4e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.23173  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2139  hypothetical protein  48.64 
 
 
313 aa  246  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2427  hypothetical protein  42.95 
 
 
318 aa  245  6e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000256327  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  43.43 
 
 
587 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1732  hypothetical protein  50 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  42.76 
 
 
587 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17980  predicted metal-dependent enzyme  46.55 
 
 
293 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000596549  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1139  hypothetical protein  46.18 
 
 
306 aa  236  3e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00478195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0412  hypothetical protein  45.42 
 
 
532 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452863  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2456  protein of unknown function DUF1385  40.07 
 
 
301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1653  hypothetical protein  43.81 
 
 
302 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0850  protein of unknown function DUF1385  44.25 
 
 
292 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.218612  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1042  hypothetical protein  45.99 
 
 
285 aa  229  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.014485  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1069  protein of unknown function DUF1385  41.08 
 
 
313 aa  225  8e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.232778  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0844  hypothetical protein  40.27 
 
 
307 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1242  hypothetical protein  44.67 
 
 
296 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1213  hypothetical protein  44.67 
 
 
296 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.727147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3374  protein of unknown function DUF1385  39.42 
 
 
308 aa  223  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0363757  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0062  protein of unknown function DUF1385  49.48 
 
 
295 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147112  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0984  hypothetical protein  41.91 
 
 
315 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0441  hypothetical protein  42.86 
 
 
304 aa  216  5.9999999999999996e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000672255  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0452  putative lipoprotein  41.88 
 
 
335 aa  215  9e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0035  hypothetical protein  42.07 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000618498  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0082  protein of unknown function DUF1385  36.16 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.547452  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2797  protein of unknown function DUF1385  43.06 
 
 
311 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17231  normal  0.519199 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20010  predicted metal-dependent enzyme  41.12 
 
 
342 aa  207  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2983  putative lipoprotein  41.25 
 
 
337 aa  205  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2300  protein of unknown function DUF1385  42.09 
 
 
304 aa  195  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1443  protein of unknown function DUF1385  40.75 
 
 
359 aa  192  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09240  predicted metal-dependent enzyme  45.79 
 
 
391 aa  192  5e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.196919  normal  0.0286438 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0230  protein of unknown function DUF1385  38.87 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2343  protein of unknown function DUF1385  36.88 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4221  hypothetical protein  38.31 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4425  hypothetical protein  38.31 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4105  hypothetical protein  38.31 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3954  hypothetical protein  38.31 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1129  protein of unknown function DUF1385  41.55 
 
 
468 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.946733  hitchhiker  0.000313529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4331  hypothetical protein  38.31 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4311  hypothetical protein  37.97 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4274  hypothetical protein  37.97 
 
 
306 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0923  hypothetical protein  37.97 
 
 
306 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4054  hypothetical protein  37.97 
 
 
306 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2895  hypothetical protein  34.58 
 
 
308 aa  170  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0132011  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0820  protein of unknown function DUF1385  41.58 
 
 
324 aa  168  9e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00433715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3943  hypothetical protein  39.11 
 
 
288 aa  158  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3638  protein of unknown function DUF1385  33.08 
 
 
281 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0037  metal-dependent enzyme-like protein  27.8 
 
 
279 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1262  hypothetical protein  28.57 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.986286  normal  0.904358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>