More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0366 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  100 
 
 
558 aa  1126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  56.44 
 
 
564 aa  644  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.01529e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  57.66 
 
 
554 aa  650  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  70.52 
 
 
593 aa  824  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  58.41 
 
 
561 aa  655  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  54.35 
 
 
560 aa  649  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  8.70726e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  56.67 
 
 
554 aa  643  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  77.24 
 
 
558 aa  907  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  74.27 
 
 
569 aa  832  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  77.24 
 
 
558 aa  904  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  85.18 
 
 
533 aa  940  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  79.39 
 
 
558 aa  922  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  53.28 
 
 
553 aa  639  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  9.54754e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  55.13 
 
 
555 aa  633  1e-180  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.00194e-06  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  54.74 
 
 
555 aa  631  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  55.47 
 
 
554 aa  632  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  54.2 
 
 
555 aa  625  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  53.83 
 
 
555 aa  618  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  53.64 
 
 
558 aa  619  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.65654e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  54.95 
 
 
553 aa  621  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  53.65 
 
 
555 aa  618  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  53.28 
 
 
554 aa  615  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.45039e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  52.62 
 
 
559 aa  607  1e-172  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  50.64 
 
 
566 aa  588  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  49.19 
 
 
618 aa  578  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  49.09 
 
 
549 aa  579  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  49.37 
 
 
555 aa  573  1e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  48.91 
 
 
560 aa  570  1e-161  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  51.89 
 
 
556 aa  570  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  52.1 
 
 
551 aa  571  1e-161  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  1.7363e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  49.45 
 
 
551 aa  563  1e-159  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  49.45 
 
 
551 aa  562  1e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  49.45 
 
 
551 aa  562  1e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.91 
 
 
557 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  52.69 
 
 
559 aa  552  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.45 
 
 
557 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  48.03 
 
 
556 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.29936e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  48.03 
 
 
556 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  48.03 
 
 
556 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.92634e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  48.21 
 
 
556 aa  550  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  47.45 
 
 
557 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  48.03 
 
 
556 aa  548  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  48.03 
 
 
556 aa  548  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  47.27 
 
 
557 aa  548  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.94402e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  48.03 
 
 
556 aa  548  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  48.03 
 
 
556 aa  548  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  4.19922e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  47.27 
 
 
557 aa  547  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.19 
 
 
557 aa  546  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.37244e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  48.03 
 
 
556 aa  548  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  47.85 
 
 
556 aa  547  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  1.58477e-13 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1939  beta-lactamase domain protein  47.21 
 
 
555 aa  546  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.01 
 
 
557 aa  545  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  47.21 
 
 
548 aa  548  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  47.99 
 
 
583 aa  544  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  46.64 
 
 
557 aa  542  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  47.26 
 
 
547 aa  538  1e-152  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  47.83 
 
 
557 aa  537  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2926  beta-lactamase domain protein  47.55 
 
 
553 aa  535  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440144 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  46.52 
 
 
555 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  46.34 
 
 
555 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  46.34 
 
 
555 aa  531  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  46.15 
 
 
555 aa  529  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  46.34 
 
 
555 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  47.46 
 
 
552 aa  530  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.33928e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  46.34 
 
 
555 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  46.34 
 
 
555 aa  531  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  46.34 
 
 
555 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.34796e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  45.97 
 
 
555 aa  528  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  46.34 
 
 
555 aa  531  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  44.73 
 
 
557 aa  525  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  46.32 
 
 
550 aa  527  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  48.28 
 
 
553 aa  526  1e-148  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  46.58 
 
 
555 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  46.52 
 
 
555 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.64083e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  45.79 
 
 
555 aa  527  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.57483e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  48.2 
 
 
561 aa  518  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  46.82 
 
 
561 aa  519  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  47.67 
 
 
561 aa  515  1e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1137  metallo-beta-lactamase family protein  48.9 
 
 
554 aa  515  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025628  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.82 
 
 
561 aa  511  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  48 
 
 
561 aa  512  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2063  beta-lactamase domain protein  46.17 
 
 
556 aa  510  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1171  beta-lactamase domain protein  45.26 
 
 
555 aa  510  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.21599e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.76 
 
 
555 aa  508  1e-142  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  45.82 
 
 
561 aa  506  1e-142  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  45.52 
 
 
591 aa  507  1e-142  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1502  beta-lactamase domain-containing protein  47.83 
 
 
561 aa  506  1e-142  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  6.03701e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  42.68 
 
 
569 aa  508  1e-142  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2106  beta-lactamase domain-containing protein  45.87 
 
 
554 aa  508  1e-142  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  44.79 
 
 
560 aa  505  1e-142  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3309  beta-lactamase domain protein  46.18 
 
 
561 aa  507  1e-142  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174304  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  45.64 
 
 
561 aa  507  1e-142  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  44.5 
 
 
565 aa  504  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  44.5 
 
 
565 aa  504  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  43.19 
 
 
677 aa  502  1e-141  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  46 
 
 
561 aa  497  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  45.11 
 
 
561 aa  495  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1115  hypothetical protein  43.35 
 
 
573 aa  496  1e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.45 
 
 
561 aa  497  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  45.36 
 
 
568 aa  497  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>