45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0338 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0338  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000696753  unclonable  2.7524400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3311  hypothetical protein  71.19 
 
 		 300 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000199952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1329  hypothetical protein  69.83 
 
 		 299 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000446037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3978  hypothetical protein  66.44 
 
 		 299 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000313749 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3890  hypothetical protein  67.11 
 
 		 299 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2614  hypothetical protein  62.37 
 
 		 299 aa  363  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.337512  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3062  hypothetical protein  54.88 
 
 		 302 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0128005  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1128  hypothetical protein  36.99 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.163819  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0366  hypothetical protein  32.55 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1593  hypothetical protein  40 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000791677  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2438  histidine kinase  31.52 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2530  histidine kinase  29.7 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.266857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2626  histidine kinase  30.12 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1329  histidine kinase  30.12 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3913  hypothetical protein  31.72 
 
 		 182 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3232  hypothetical protein  29.25 
 
 		 183 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209662 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0381  hypothetical protein  28.57 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0014  diguanylate cyclase  28.21 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0018  diguanylate cyclase  28.21 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000219286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0018  diguanylate cyclase  28.21 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0128135 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0506  hypothetical protein  30.34 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0014  diguanylate cyclase  25 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0014  diguanylate cyclase  25 
 
 		 397 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0484  hypothetical protein  27.14 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.875691  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1704  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.28879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1801  hypothetical protein  33.91 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.103514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2647  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.33 
 
 		 498 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.835336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0022  diguanylate cyclase  24.31 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.585928  hitchhiker  0.0000000315771 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1836  hypothetical protein  31.62 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2173  hypothetical protein, GGDEF domain  32.95 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.86 
 
 		 432 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457708  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1800  hypothetical protein  29.58 
 
 		 183 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.177619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1833  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.39 
 
 		 515 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.239593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0963  anti-sigma-factor antagonist  24.32 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2403  hypothetical protein  27.63 
 
 		 186 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0844  hypothetical protein  28.7 
 
 		 172 aa  49.3  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0384719  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1977  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.39 
 
 		 485 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.911865  normal  0.282235 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1314  hypothetical protein  35.82 
 
 		 80 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5252  hypothetical protein  31.68 
 
 		 185 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.379196 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.23 
 
 		 505 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0566767  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3654  diguanylate cyclase  22.14 
 
 		 473 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271139  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1430  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 		 481 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105361  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0572  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.63 
 
 		 245 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00328784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5211  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 445 aa  42.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1194  diguanylate cyclase  27.27 
 
 		 471 aa  42.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361877  normal  0.129887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>