44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0291 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0291  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  683    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3186  hypothetical protein  74.7 
 
 		 335 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4073  hypothetical protein  40.54 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125532 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0538  hypothetical protein  32.17 
 
 		 373 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0171  hypothetical protein  30.56 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01180  hypothetical protein  30.56 
 
 		 399 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.176675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2759  hypothetical protein  31.64 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2334  hypothetical protein  29.59 
 
 		 370 aa  139  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00524729  normal  0.0110062 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7055  hypothetical protein  30.82 
 
 		 356 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0582367  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.860855 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3387  hypothetical protein  30.25 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128743  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2439  hypothetical protein  29.29 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.310656 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3112  hypothetical protein  28.66 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192331  normal  0.139244 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3467  hypothetical protein  28.36 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05867  hypothetical protein  24.52 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000445  pentapeptide repeat family protein  24.52 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2827  hypothetical protein  30.57 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2738  hypothetical protein  27.83 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2438  Protein of unknown function DUF2169  26.3 
 
 		 383 aa  94  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1192  hypothetical protein  26.02 
 
 		 447 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3484  hypothetical protein  26.88 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3786  hypothetical protein  26.11 
 
 		 343 aa  87.8  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  26.99 
 
 		 862 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7560  hypothetical protein  30.03 
 
 		 348 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  26.99 
 
 		 825 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  27.14 
 
 		 825 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  26.99 
 
 		 825 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  26.99 
 
 		 825 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  26.99 
 
 		 825 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  26.99 
 
 		 825 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  28.08 
 
 		 886 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  27.76 
 
 		 846 aa  75.1  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4428  hypothetical protein  25.53 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  35.62 
 
 		 844 aa  73.2  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 		 870 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3869  hypothetical protein  24.26 
 
 		 438 aa  66.2  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0106797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2128  hypothetical protein  25.7 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469876 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  27.65 
 
 		 976 aa  63.9  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  32.03 
 
 		 881 aa  59.7  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0930  hypothetical protein  27.73 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0087813  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  23.35 
 
 		 949 aa  57  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  28.29 
 
 		 866 aa  52.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6142  hypothetical protein  28.12 
 
 		 192 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3016  hypothetical protein  48.89 
 
 		 320 aa  49.7  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>