134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0273 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0273  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3165  hypothetical protein  66.08 
 
 		 264 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3046  hypothetical protein  52.07 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1204  type IV / VI secretion system protein, DotU family  51.61 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0856  hypothetical protein  35.47 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0132615  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2137  hypothetical protein  39.37 
 
 		 221 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202208  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0731  hypothetical protein  38.58 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.696418  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0546  hypothetical protein  38.58 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0618  hypothetical protein  38.58 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0433758  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0729  hypothetical protein  38.58 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.058958  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2039  hypothetical protein  38.58 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1687  hypothetical protein  38.58 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0016  hypothetical protein  28.57 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  36.04 
 
 		 429 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2810  hypothetical protein  30.05 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.442951  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4909  type IV / VI secretion system protein, DotU family  32.67 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0340153  normal  0.0265168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2181  hypothetical protein  33.93 
 
 		 257 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0744334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  30.37 
 
 		 273 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0377  hypothetical protein  35.59 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0398  hypothetical protein  34.75 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2968  ompA family protein, putative  34.75 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.522224  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3640  hypothetical protein  34.75 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00234142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3665  hypothetical protein  34.75 
 
 		 261 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3649  hypothetical protein  34.75 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.106209  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2643  hypothetical protein  35.59 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0441  hypothetical protein  35.59 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31423  normal  0.269531 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0463  hypothetical protein  35.59 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0554  hypothetical protein  28.89 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.404034  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3555  hypothetical protein  35.59 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0262409  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2934  hypothetical protein  34.75 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  33.08 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01969  hypothetical protein  33.05 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  27.35 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  27.07 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.82 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  27.35 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  27.84 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  34.48 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02041  hypothetical protein  39.13 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928421  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  28.18 
 
 		 456 aa  59.3  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  34.48 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  31.09 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  31.58 
 
 		 293 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  34.34 
 
 		 453 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  33.64 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  33.7 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000429  ImpK/VasF outer membrane protein  30.6 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2502  hypothetical protein  33.87 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4081  hypothetical protein  27.52 
 
 		 310 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.000110004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4961  hypothetical protein  35.64 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  36.84 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  34.4 
 
 		 449 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05851  hypothetical protein  31.34 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  36.84 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2263  hypothetical protein  36.79 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  28.7 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  29.73 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  34.4 
 
 		 449 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  30.63 
 
 		 443 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2558  hypothetical protein  26.85 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.654353  normal  0.0571699 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  31.19 
 
 		 413 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  27.36 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1222  hypothetical protein  29.52 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.619966 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  35.05 
 
 		 452 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  28.27 
 
 		 460 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1103  Aec26  29.52 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2859  hypothetical protein  30.68 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486796  normal  0.274768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  27.27 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3092  hypothetical protein  34.23 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0238  hypothetical protein  29.52 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2630  hypothetical protein  34.23 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.248355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  29.52 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3126  DotU family type IV/VI secretion system protein  29.46 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  26.63 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  26.9 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0232  hypothetical protein  28.57 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2772  hypothetical protein  34.95 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0590674  normal  0.439335 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  26.9 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  29.29 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  26.87 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  24.79 
 
 		 469 aa  52  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  30.66 
 
 		 453 aa  51.6  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  29.41 
 
 		 460 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  29.82 
 
 		 440 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  29.82 
 
 		 437 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  29.82 
 
 		 438 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  29.82 
 
 		 438 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  34.72 
 
 		 463 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  29.82 
 
 		 438 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  29.82 
 
 		 438 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  34.04 
 
 		 453 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  29.82 
 
 		 438 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  29.82 
 
 		 438 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  29.82 
 
 		 438 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  32.99 
 
 		 430 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  34.67 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  25.29 
 
 		 434 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  26.28 
 
 		 458 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  26.28 
 
 		 458 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5263  hypothetical protein  29.63 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>