More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0249 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  83.95 
 
 		 541 aa  896    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  71.24 
 
 		 541 aa  728    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  77.51 
 
 		 539 aa  865    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  70.33 
 
 		 539 aa  762    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2526  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit I  73.5 
 
 		 543 aa  758    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000123308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 		 541 aa  1073    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1823  cytochrome-c oxidase  70.09 
 
 		 543 aa  731    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200006  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  72.78 
 
 		 541 aa  772    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  77.45 
 
 		 542 aa  823    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  56.59 
 
 		 542 aa  619  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  57.2 
 
 		 564 aa  582  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0230  cytochrome c oxidase, subunit I  56.7 
 
 		 565 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123434  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  55.09 
 
 		 552 aa  579  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  54.28 
 
 		 548 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  54.51 
 
 		 556 aa  568  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  55.25 
 
 		 545 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  54.37 
 
 		 563 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  54.37 
 
 		 563 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  53.85 
 
 		 563 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  54.14 
 
 		 554 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  52.03 
 
 		 544 aa  553  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  52.9 
 
 		 535 aa  551  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4179  cytochrome c oxidase, subunit I  55.02 
 
 		 557 aa  551  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263418  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0827  cytochrome c oxidase, subunit I  53.07 
 
 		 540 aa  547  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.541437  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0849  cytochrome c oxidase subunit I type  50.95 
 
 		 555 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  51.54 
 
 		 558 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0856  cytochrome c oxidase, subunit I  50.28 
 
 		 554 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0852  cytochrome c oxidase, subunit I  50.28 
 
 		 554 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  52.31 
 
 		 565 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5816  cytochrome c oxidase, subunit I  52.7 
 
 		 558 aa  532  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099341  hitchhiker  0.00453601 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0804  cytochrome-c oxidase  50.09 
 
 		 554 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6885  cytochrome c oxidase, subunit I  52.7 
 
 		 558 aa  530  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2274  cytochrome-c oxidase  52.39 
 
 		 554 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.413145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1601  cytochrome c oxidase, subunit I  52.39 
 
 		 555 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  47.34 
 
 		 587 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1677  cytochrome c oxidase, subunit I  52.2 
 
 		 555 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2705  Cytochrome-c oxidase  51.92 
 
 		 528 aa  493  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  46.76 
 
 		 555 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  46.76 
 
 		 555 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  46.37 
 
 		 541 aa  464  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  45.1 
 
 		 540 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  44.86 
 
 		 560 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  46.37 
 
 		 559 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  44.4 
 
 		 590 aa  456  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  44.6 
 
 		 548 aa  456  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  43.97 
 
 		 615 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  45.78 
 
 		 575 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  43.73 
 
 		 536 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  44.81 
 
 		 543 aa  453  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  46.17 
 
 		 564 aa  454  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  44.73 
 
 		 534 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1675  cytochrome c oxidase, subunit I  44.42 
 
 		 556 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3906  cytochrome-c oxidase  44.03 
 
 		 547 aa  450  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701239  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  45.42 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4391  cytochrome c oxidase, subunit I  43.99 
 
 		 543 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  45.42 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  42.83 
 
 		 530 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  45.42 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  45.28 
 
 		 661 aa  451  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  44.2 
 
 		 539 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  45.42 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  42.83 
 
 		 530 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  45.42 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  42.83 
 
 		 530 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  45.42 
 
 		 535 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  42.83 
 
 		 531 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  44.4 
 
 		 553 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  43.73 
 
 		 534 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  43.73 
 
 		 530 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  45.42 
 
 		 535 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0238  cytochrome c oxidase, subunit I  44.53 
 
 		 534 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  43.45 
 
 		 638 aa  445  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  44.31 
 
 		 534 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  45.22 
 
 		 535 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0262  cytochrome c oxidase subunit I  44.42 
 
 		 536 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  42.64 
 
 		 530 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  42.64 
 
 		 530 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0219  cytochrome c oxidase, subunit I  44.14 
 
 		 534 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1039  cytochrome c oxidase, subunit I  43.99 
 
 		 536 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6175  cytochrome-c oxidase  45.03 
 
 		 535 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  42.67 
 
 		 566 aa  444  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  42.45 
 
 		 530 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  43.61 
 
 		 529 aa  443  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2859  cytochrome c oxidase, subunit I  43.84 
 
 		 544 aa  443  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.605233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2763  cytochrome c oxidase, subunit I  45.22 
 
 		 535 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1246  cytochrome-c oxidase  44.21 
 
 		 544 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4170  cytochrome-c oxidase  45.42 
 
 		 537 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.751334 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  43.11 
 
 		 535 aa  443  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3819  cytochrome c oxidase, subunit I  43.9 
 
 		 544 aa  443  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.247666 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2232  cytochrome-c oxidase  45.03 
 
 		 535 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  43.73 
 
 		 531 aa  444  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  42.45 
 
 		 530 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06271  cytochrome c oxidase, subunit I  43.14 
 
 		 546 aa  442  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0879  cytochrome-c oxidase  44.19 
 
 		 544 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0063  cytochrome-c oxidase  43.53 
 
 		 527 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0545  cytochrome c oxidase, subunit I  44.64 
 
 		 537 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2901  cytochrome-c oxidase  45.03 
 
 		 535 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2846  cytochrome-c oxidase  45.03 
 
 		 535 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591708  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2857  cytochrome c oxidase, subunit I  45.03 
 
 		 535 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.978045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0143  cytochrome-c oxidase  43.53 
 
 		 527 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>