14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0233 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0233  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  248  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.86465e-19  hitchhiker  8.74497e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0819  hypothetical protein  49.21 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000980503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2108  hypothetical protein  62.5 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0285  hypothetical protein  47.06 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00144128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3535  hypothetical protein  46.84 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0147192  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3442  hypothetical protein  58.54 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.6631e-29 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2597  hypothetical protein  57.78 
 
 		 217 aa  52.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0869  proline-rich region  48.08 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.426723  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0152  proline-rich region  44.78 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2680  hypothetical protein  36.43 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.298826  normal  0.0266108 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0536  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.497522  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2916  hypothetical protein  38.36 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0147  hypothetical protein  64 
 
 		 226 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6178  hypothetical protein  32.85 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>