33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0228 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0228  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  unclonable  5.55039e-23 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5133  zinc/iron permease  46.55 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426324  normal  0.124574 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6776  transporter  42.67 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2368  hypothetical protein  44.44 
 
 		 242 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2839  integral membrane protein  40.35 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2515  hypothetical protein  43.98 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6180  hypothetical protein  38.56 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4676  hypothetical protein  37.71 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.257813  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3687  hypothetical protein  37.71 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2423  hypothetical protein  37.67 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0028  hypothetical protein  38.6 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2150  zinc uptake transporter  38.16 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4452  putative integral membrane protein  39.56 
 
 		 244 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.457589  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3835  hypothetical protein  39.64 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.686923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7280  integral membrane protein  39.23 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10323  integral membrane protein  34.47 
 
 		 264 aa  87  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7423  hypothetical protein  37.91 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.104528 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1342  peptidoglycan-binding LysM  28.76 
 
 		 389 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.779699  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4074  putative membrane protein of unknown function  37.86 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44305 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1307  zinc/iron permease  30.21 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0428  peptidoglycan-binding LysM  28.18 
 
 		 220 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0424  hypothetical protein  30.73 
 
 		 244 aa  49.7  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  26.44 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  31.75 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  28.07 
 
 		 260 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  28.07 
 
 		 260 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  27.88 
 
 		 300 aa  46.6  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  25.7 
 
 		 278 aa  45.8  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0092  hypothetical protein  24.87 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  25 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  28.94 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  27.43 
 
 		 271 aa  42  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4121  zinc/iron permease  25.65 
 
 		 259 aa  41.6  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.543426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>