102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0227 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0227  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  854    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  unclonable  1.0640799999999999e-22 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3026  protein of unknown function DUF445  72.62 
 
 		 420 aa  629  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3542  hypothetical protein  60.62 
 
 		 420 aa  543  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3090  protein of unknown function DUF445  56.09 
 
 		 421 aa  487  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000113555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1171  protein of unknown function DUF445  55.5 
 
 		 421 aa  455  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.23014e-26 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2464  protein of unknown function DUF445  40.26 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.994281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2843  hypothetical protein  40.26 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.536619  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00474  hypothetical protein  36.43 
 
 		 409 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20187  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5378  protein of unknown function DUF445  39.17 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240077 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1234  hypothetical protein  40.1 
 
 		 429 aa  276  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.202183  normal  0.355956 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7202  hypothetical protein  36.34 
 
 		 426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362137 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0507  hypothetical protein  38.74 
 
 		 432 aa  270  4e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0606  hypothetical protein  33.67 
 
 		 451 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0415  protein of unknown function DUF445  38.13 
 
 		 452 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0423  hypothetical protein  38.13 
 
 		 452 aa  268  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3726  hypothetical protein  36.56 
 
 		 430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4938  hypothetical protein  37.96 
 
 		 426 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04205  conserved inner membrane protein  37.96 
 
 		 426 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.105844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3659  protein of unknown function DUF445  37.96 
 
 		 426 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4883  hypothetical protein  37.96 
 
 		 426 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.899072 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4768  putatitve membrane protein  37.96 
 
 		 426 aa  265  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4921  hypothetical protein  38.42 
 
 		 423 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.192756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4919  putative inner membrane protein  38.42 
 
 		 423 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.346159  normal  0.443006 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04168  hypothetical protein  37.96 
 
 		 426 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0783971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4564  hypothetical protein  37.7 
 
 		 426 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4773  hypothetical protein  38.16 
 
 		 423 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4847  putative inner membrane protein  38.42 
 
 		 423 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4871  hypothetical protein  38.16 
 
 		 423 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3671  hypothetical protein  41.75 
 
 		 428 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.798798  normal  0.653715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0330  protein of unknown function DUF445  42.38 
 
 		 407 aa  259  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5506  hypothetical protein  41.49 
 
 		 451 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5850  hypothetical protein  37.7 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1327  protein of unknown function DUF445  37.97 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0453497 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0641  hypothetical protein  38.61 
 
 		 435 aa  256  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1102  hypothetical protein  35.38 
 
 		 442 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2315  hypothetical protein  40 
 
 		 428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3744  hypothetical protein  40.22 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4584  hypothetical protein  39.95 
 
 		 428 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0647128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3779  hypothetical protein  39.95 
 
 		 428 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4953  hypothetical protein  40 
 
 		 428 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.619831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0221  hypothetical protein  35.24 
 
 		 442 aa  244  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0495  hypothetical protein  39.95 
 
 		 428 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0561  hypothetical protein  33.92 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.932645  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2554  hypothetical protein  39.19 
 
 		 444 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137947  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0976  hypothetical protein  39.69 
 
 		 428 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4572  protein of unknown function DUF445  35.9 
 
 		 427 aa  239  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2699  hypothetical protein  39.19 
 
 		 444 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3759  hypothetical protein  33.17 
 
 		 420 aa  237  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.414888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2465  protein of unknown function DUF445  32.7 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0622  protein of unknown function DUF445  33.49 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02279  hypothetical protein  32.71 
 
 		 379 aa  219  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331873  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0030  hypothetical protein  31.34 
 
 		 425 aa  217  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29018  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0772  protein of unknown function DUF445  32.62 
 
 		 445 aa  216  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4743  hypothetical protein  33.66 
 
 		 423 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  0.53724 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3660  protein of unknown function DUF445  30.44 
 
 		 435 aa  213  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0319  hypothetical protein  32.78 
 
 		 446 aa  212  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0542  protein of unknown function DUF445  31.83 
 
 		 449 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0641  hypothetical protein  31.46 
 
 		 440 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332737  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0654  hypothetical protein  31.46 
 
 		 440 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.495865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0634  hypothetical protein  31.46 
 
 		 440 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0302528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0473  hypothetical protein  29.51 
 
 		 421 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.83946 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10481  transmembrane protein  31.43 
 
 		 456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2381  hypothetical protein  32.7 
 
 		 431 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0836  protein of unknown function DUF445  30.82 
 
 		 453 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0102  hypothetical protein  31.84 
 
 		 428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01710  predicted membrane protein  30.94 
 
 		 425 aa  196  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02420  predicted membrane protein  29.45 
 
 		 427 aa  196  7e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.906316 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4582  hypothetical protein  33.87 
 
 		 404 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790013  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0038  hypothetical protein  33.41 
 
 		 401 aa  190  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0806  hypothetical protein  31.86 
 
 		 447 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1763  hypothetical protein  29.43 
 
 		 417 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6776  protein of unknown function DUF445  29.59 
 
 		 418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349054  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0899  protein of unknown function DUF445  29.36 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000836481  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0657  protein of unknown function DUF445  32.24 
 
 		 426 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1692  hypothetical protein  28.4 
 
 		 420 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0297982  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4691  protein of unknown function DUF445  29.83 
 
 		 430 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0857434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1566  hypothetical protein  29.27 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2863  hypothetical protein  29.3 
 
 		 433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0677872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16810  predicted membrane protein  28.35 
 
 		 395 aa  156  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.920314  normal  0.0495417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1309  protein of unknown function DUF445  29.95 
 
 		 424 aa  150  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.295352  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2056  hypothetical protein  27.98 
 
 		 425 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0262508  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1387  hypothetical protein  43.41 
 
 		 491 aa  143  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1986  protein of unknown function DUF445  26.76 
 
 		 345 aa  142  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3307  protein of unknown function DUF445  28.33 
 
 		 437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0383951  normal  0.0408752 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0105  membrane protein-like  26.43 
 
 		 272 aa  126  8.000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1651  hypothetical protein  23.57 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1654  hypothetical protein  22.06 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000922298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1785  hypothetical protein  22.06 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.651448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1834  hypothetical protein  22.06 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1632  hypothetical protein  22.25 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0643525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1601  hypothetical protein  23.33 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.661113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1797  hypothetical protein  23.15 
 
 		 415 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.747365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1856  hypothetical protein  22.91 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.125327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3544  hypothetical protein  21.82 
 
 		 415 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1583  hypothetical protein  38.01 
 
 		 182 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1908  hypothetical protein  23.15 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00182785  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1421  hypothetical protein  21.12 
 
 		 415 aa  99.8  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1998  protein of unknown function DUF445  23.79 
 
 		 447 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4524  protein of unknown function DUF445  23.44 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104757  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4525  protein of unknown function DUF445  23.33 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000070916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>