More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0171 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3430  NADH dehydrogenase I, M subunit  86.49 
 
 
496 aa  806    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0314  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  73.83 
 
 
493 aa  679    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0171  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 
496 aa  969    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0168  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  61.55 
 
 
494 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0150  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  62.37 
 
 
495 aa  567  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.81 
 
 
535 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.51 
 
 
525 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.51 
 
 
535 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.75 
 
 
517 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.33 
 
 
497 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  43.97 
 
 
522 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.88 
 
 
519 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  44.06 
 
 
502 aa  378  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.52 
 
 
542 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.36 
 
 
535 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  42.77 
 
 
510 aa  378  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  44.06 
 
 
502 aa  376  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.73 
 
 
542 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  43.95 
 
 
505 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.08 
 
 
507 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  43.09 
 
 
501 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1805  NADH dehydrogenase subunit M  44.39 
 
 
510 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.168858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  43.55 
 
 
505 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1010  NADH dehydrogenase subunit M  45.23 
 
 
514 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2558  NADH dehydrogenase subunit M  44.26 
 
 
509 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  43.35 
 
 
502 aa  375  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1571  NADH dehydrogenase subunit M  44.39 
 
 
510 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.69 
 
 
542 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  43.18 
 
 
502 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.98 
 
 
495 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1465  NADH dehydrogenase subunit M  44.16 
 
 
510 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.06 
 
 
503 aa  371  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  42.48 
 
 
502 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29860  NADH dehydrogenase subunit M  44.26 
 
 
509 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000573313  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1024  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.42 
 
 
500 aa  366  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.272198  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  43.35 
 
 
496 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  46.15 
 
 
506 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  42.48 
 
 
505 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  40.52 
 
 
489 aa  367  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  43.88 
 
 
502 aa  369  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3297  NADH dehydrogenase subunit M  43.46 
 
 
509 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.416453 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  42.94 
 
 
496 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  42.94 
 
 
496 aa  362  8e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  42.94 
 
 
496 aa  362  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  42.94 
 
 
496 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  42.94 
 
 
496 aa  362  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  42.94 
 
 
496 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  42.94 
 
 
496 aa  362  8e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1503  NADH dehydrogenase subunit M  41.75 
 
 
511 aa  362  9e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  42.97 
 
 
512 aa  362  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4402  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.01 
 
 
506 aa  360  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.807836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4155  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  47.73 
 
 
534 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0166298 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2416  NADH dehydrogenase subunit M  46.15 
 
 
506 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185861  hitchhiker  0.00201163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3121  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.03 
 
 
513 aa  361  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0441802  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  43.15 
 
 
496 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1295  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.25 
 
 
559 aa  360  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  43.15 
 
 
496 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  43.15 
 
 
496 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  42.74 
 
 
496 aa  358  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  42.66 
 
 
503 aa  358  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0215  NADH dehydrogenase I chain M  47.49 
 
 
491 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  42.94 
 
 
496 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2821  NADH dehydrogenase subunit M  43.88 
 
 
509 aa  358  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.43  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  42.94 
 
 
496 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1037  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.73 
 
 
525 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.260264  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  42.74 
 
 
496 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2556  NADH dehydrogenase subunit M  40.98 
 
 
509 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2456  NADH dehydrogenase subunit M  40.98 
 
 
509 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2545  NADH dehydrogenase subunit M  40.98 
 
 
509 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2501  NADH dehydrogenase subunit M  40.98 
 
 
509 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2663  NADH dehydrogenase subunit M  40.98 
 
 
509 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3214  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.91 
 
 
514 aa  357  2.9999999999999997e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02202  NADH dehydrogenase subunit M  41.19 
 
 
509 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.786903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.19 
 
 
509 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02162  hypothetical protein  41.19 
 
 
509 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3416  NADH dehydrogenase subunit M  41.19 
 
 
509 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2426  NADH dehydrogenase subunit M  41.19 
 
 
509 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2570  NADH dehydrogenase subunit M  41.19 
 
 
509 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2431  NADH dehydrogenase subunit M  41.19 
 
 
509 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1375  NADH dehydrogenase subunit M  41.19 
 
 
509 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2653  NADH dehydrogenase subunit M  40.98 
 
 
509 aa  356  5e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0754  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.87 
 
 
501 aa  356  5.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2761  NADH dehydrogenase subunit M  42.89 
 
 
511 aa  356  6.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28550  NADH dehydrogenase subunit M  44.06 
 
 
509 aa  355  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.74 
 
 
494 aa  354  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.71 
 
 
585 aa  355  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341288  normal  0.991992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  44.62 
 
 
503 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  42.74 
 
 
494 aa  354  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2819  NADH dehydrogenase subunit M  40.28 
 
 
502 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0961  NADH dehydrogenase subunit M  40.69 
 
 
494 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0280946  normal  0.49186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  41.45 
 
 
503 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1248  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.62 
 
 
534 aa  353  4e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130648  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.54 
 
 
503 aa  353  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1405  NADH dehydrogenase subunit M  43.46 
 
 
532 aa  351  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  42.54 
 
 
513 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2529  NADH dehydrogenase subunit M  42 
 
 
513 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0432269  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  41.82 
 
 
514 aa  351  2e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1190  NADH dehydrogenase subunit M  42 
 
 
513 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.602239  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2050  NADH dehydrogenase subunit M  43.76 
 
 
488 aa  350  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232549  normal  0.0955875 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3814  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.8 
 
 
490 aa  350  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>