More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0163 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  100 
 
 
184 aa  378  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  93.18 
 
 
176 aa  337  8e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  82.39 
 
 
176 aa  304  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  69.32 
 
 
176 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0154  NADH dehydrogenase subunit I  69.32 
 
 
176 aa  261  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.947551 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  64.2 
 
 
176 aa  243  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1940  NADH dehydrogenase subunit I  64.91 
 
 
178 aa  227  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.509162 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  60.98 
 
 
171 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  59.76 
 
 
171 aa  208  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1113  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  60.37 
 
 
170 aa  205  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182151  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  55 
 
 
180 aa  204  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1352  NADH dehydrogenase subunit I  59.76 
 
 
171 aa  204  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  58.79 
 
 
182 aa  204  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  59.15 
 
 
182 aa  202  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  58.54 
 
 
182 aa  201  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  57.93 
 
 
182 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  57.93 
 
 
182 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  57.93 
 
 
182 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  57.93 
 
 
182 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  57.32 
 
 
182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  57.32 
 
 
182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  55.43 
 
 
180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  55.43 
 
 
180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  55.43 
 
 
180 aa  198  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  56.97 
 
 
182 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  56.97 
 
 
182 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3125  NADH dehydrogenase subunit I  58.54 
 
 
179 aa  197  7.999999999999999e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1014  NADH dehydrogenase subunit I  53.89 
 
 
180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0711  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  58.93 
 
 
170 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425782  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  53.14 
 
 
180 aa  194  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  54.29 
 
 
180 aa  194  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1401  NADH dehydrogenase subunit I  53.71 
 
 
180 aa  194  8.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.590324  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  52.57 
 
 
180 aa  192  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  52.57 
 
 
180 aa  192  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  53.71 
 
 
180 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  53.71 
 
 
180 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  53.71 
 
 
180 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  53.71 
 
 
180 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  53.71 
 
 
180 aa  191  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1376  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  53.71 
 
 
180 aa  191  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00237006  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  53.71 
 
 
180 aa  191  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  53.71 
 
 
180 aa  191  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  55.03 
 
 
182 aa  191  7e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2435  NADH dehydrogenase subunit I  53.71 
 
 
180 aa  191  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  53.71 
 
 
180 aa  191  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1371  NADH dehydrogenase subunit I  53.71 
 
 
180 aa  191  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583652  normal  0.392913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  53.71 
 
 
180 aa  191  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2574  NADH dehydrogenase subunit I  53.71 
 
 
180 aa  191  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  53.14 
 
 
180 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2825  NADH dehydrogenase subunit I  58.23 
 
 
180 aa  188  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339444  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2867  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  57.32 
 
 
171 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.708253  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0374  NADH dehydrogenase subunit I  52.57 
 
 
180 aa  184  5e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0591  NADH dehydrogenase subunit I  53.85 
 
 
182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0623179  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0580  NADH dehydrogenase subunit I  53.85 
 
 
182 aa  182  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0627884  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1696  NADH dehydrogenase subunit I  52.35 
 
 
164 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00251501  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4064  NADH dehydrogenase subunit I  52.73 
 
 
171 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0149353  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  51.76 
 
 
164 aa  165  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  52.94 
 
 
164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1354  NADH dehydrogenase subunit I  52.83 
 
 
171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.253044  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1333  NADH dehydrogenase subunit I  52.83 
 
 
171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4736  NADH dehydrogenase subunit I  50 
 
 
173 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161018  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.09 
 
 
211 aa  127  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.93 
 
 
175 aa  127  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.2 
 
 
194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  44.36 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.26 
 
 
171 aa  125  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  43.97 
 
 
177 aa  124  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  46.51 
 
 
188 aa  124  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  43.41 
 
 
211 aa  123  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.98 
 
 
179 aa  123  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  43.41 
 
 
211 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  44.96 
 
 
199 aa  122  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  44.2 
 
 
171 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  42.55 
 
 
217 aa  121  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.51 
 
 
185 aa  121  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4080  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.21 
 
 
197 aa  121  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0562629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  42.55 
 
 
211 aa  121  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  36.9 
 
 
247 aa  121  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.41 
 
 
199 aa  120  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  46.51 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  44.03 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  44.96 
 
 
187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.96 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  43.8 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.8 
 
 
226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.78 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  37.7 
 
 
175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  43.26 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  43.26 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  43.26 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  43.7 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  46.27 
 
 
165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.35 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  39.86 
 
 
254 aa  115  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  41.84 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5106  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.6 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  45.52 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  40.69 
 
 
300 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  42.96 
 
 
175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  42.64 
 
 
167 aa  112  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>