More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0157 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0329  NADH dehydrogenase (quinone)  82.58 
 
 
433 aa  718    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3441  NADH dehydrogenase I, F subunit  93.13 
 
 
423 aa  817    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0157  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 
422 aa  860    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0158  NADH dehydrogenase (quinone)  75.18 
 
 
421 aa  659    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.589974 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0176  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  74.22 
 
 
421 aa  655    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0208  NADH dehydrogenase I chain F  60.14 
 
 
425 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1123  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.05 
 
 
429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1017  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.3 
 
 
425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3821  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.72 
 
 
426 aa  450  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.400637  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1955  NADH dehydrogenase (quinone)  58.75 
 
 
421 aa  445  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0948172  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1355  NADH dehydrogenase I, F subunit  54.68 
 
 
427 aa  443  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1496  NADH dehydrogenase I subunit F  53.51 
 
 
449 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.376582  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1458  NADH dehydrogenase I subunit F  52.63 
 
 
461 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1564  NADH dehydrogenase I subunit F  52.63 
 
 
461 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1812  NADH dehydrogenase I subunit F  52.63 
 
 
461 aa  431  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.848425 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2768  NADH dehydrogenase I subunit F  53.27 
 
 
449 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.261993  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2828  NADH dehydrogenase I subunit F  52.67 
 
 
445 aa  425  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.208712  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3423  NADH dehydrogenase I subunit F  52.18 
 
 
445 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02209  NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain F  52.18 
 
 
445 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1373  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.18 
 
 
445 aa  424  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00215992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02169  hypothetical protein  52.18 
 
 
445 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2660  NADH dehydrogenase I subunit F  52.18 
 
 
445 aa  424  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.142172  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2670  NADH dehydrogenase I subunit F  51.94 
 
 
445 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.793863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2433  NADH dehydrogenase I subunit F  52.18 
 
 
445 aa  424  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2508  NADH dehydrogenase I subunit F  51.94 
 
 
445 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2563  NADH dehydrogenase I subunit F  51.94 
 
 
445 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2864  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.36 
 
 
454 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0700873  hitchhiker  0.00675695 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1368  NADH dehydrogenase I subunit F  52.18 
 
 
445 aa  424  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.104051  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2463  NADH dehydrogenase I subunit F  51.94 
 
 
445 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.560534  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2577  NADH dehydrogenase I subunit F  52.18 
 
 
445 aa  424  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.85076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2438  NADH dehydrogenase I subunit F  52.18 
 
 
445 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2552  NADH dehydrogenase I subunit F  51.94 
 
 
445 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3304  NADH dehydrogenase I subunit F  51.92 
 
 
450 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0360562  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1116  NADH dehydrogenase (quinone)  50.83 
 
 
434 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3695  NADH dehydrogenase I subunit F  52.81 
 
 
454 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196409  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4123  NADH dehydrogenase I subunit F  52.81 
 
 
453 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.67 
 
 
439 aa  411  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1742  NADH dehydrogenase I subunit F  52.81 
 
 
453 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00767478  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1869  NADH dehydrogenase I subunit F  52.81 
 
 
458 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.123144 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1017  NADH dehydrogenase I subunit F  50.72 
 
 
461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.6 
 
 
433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0588  NADH dehydrogenase I, F subunit  50.36 
 
 
474 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0577  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.72 
 
 
474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1398  NADH dehydrogenase I subunit F  52.58 
 
 
449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.940574  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2566  NADH dehydrogenase I subunit F  51.09 
 
 
448 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2546  NADH dehydrogenase I subunit F  54 
 
 
449 aa  405  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698943  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1695  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50 
 
 
537 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.316564  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28480  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.1 
 
 
449 aa  398  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2416  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.1 
 
 
448 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0718255  normal  0.148536 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.75 
 
 
421 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3201  NADH dehydrogenase I subunit F  50.61 
 
 
452 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103684  normal  0.0135586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  50.38 
 
 
428 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3607  NADH dehydrogenase I subunit F  50.12 
 
 
451 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4067  NADH dehydrogenase (quinone)  51.56 
 
 
428 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0902793  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.63 
 
 
441 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3369  NADH dehydrogenase I, F subunit  50.36 
 
 
452 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0377  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.67 
 
 
444 aa  389  1e-107  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.372414  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.87 
 
 
438 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0714  NADH dehydrogenase (quinone)  53.69 
 
 
428 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.75 
 
 
448 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  48.79 
 
 
428 aa  383  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.75 
 
 
434 aa  381  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.28 
 
 
440 aa  378  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2711  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.39 
 
 
444 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  49.75 
 
 
449 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.05 
 
 
441 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.45 
 
 
434 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.41 
 
 
427 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.05 
 
 
441 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.05 
 
 
441 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.28 
 
 
456 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.41 
 
 
427 aa  374  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  47.07 
 
 
445 aa  372  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.49 
 
 
448 aa  372  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.22 
 
 
447 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1170  NADH dehydrogenase (quinone)  46.4 
 
 
602 aa  369  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.7 
 
 
441 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.57 
 
 
706 aa  368  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.46 
 
 
426 aa  364  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3128  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47 
 
 
446 aa  365  1e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.48 
 
 
426 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  44.69 
 
 
610 aa  361  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.55 
 
 
443 aa  360  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.37 
 
 
449 aa  359  5e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  46.42 
 
 
426 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  44.79 
 
 
422 aa  358  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.88 
 
 
425 aa  358  9.999999999999999e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  46.14 
 
 
451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.64 
 
 
442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1377  NADH dehydrogenase I chain F  46.01 
 
 
448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0721979  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  45.43 
 
 
422 aa  356  2.9999999999999997e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1575  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.17 
 
 
438 aa  356  5e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1599  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.17 
 
 
438 aa  356  5e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  45.43 
 
 
422 aa  355  5.999999999999999e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3862  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  45.41 
 
 
443 aa  355  7.999999999999999e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0696  NADH dehydrogenase (quinone)  44.91 
 
 
545 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000417436  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4458  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.12 
 
 
443 aa  355  1e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0633  NADH dehydrogenase (quinone)  45.15 
 
 
427 aa  355  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1628  NADH dehydrogenase (quinone)  45.15 
 
 
427 aa  355  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3188  NADH dehydrogenase (quinone)  45.15 
 
 
427 aa  355  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>