26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0127 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0127  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0197802  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3326  hypothetical protein  81.89 
 
 
243 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0284  hypothetical protein  74.49 
 
 
243 aa  371  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0086  Protein of unknown function DUF1847  72.29 
 
 
241 aa  350  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43245e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0104  Protein of unknown function DUF1847  71 
 
 
241 aa  344  6e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193044  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2021  hypothetical protein  48.67 
 
 
222 aa  211  9e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.457278 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2788  hypothetical protein  47.21 
 
 
218 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1986  hypothetical protein  44.4 
 
 
226 aa  197  9e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1064  Protein of unknown function DUF1847  44.35 
 
 
219 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.253375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1436  Protein of unknown function DUF1847  44.68 
 
 
226 aa  192  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2679  Protein of unknown function DUF1847  46.43 
 
 
221 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4575  Protein of unknown function DUF1847  43.53 
 
 
218 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000363898  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1219  Protein of unknown function DUF1847  42.86 
 
 
226 aa  186  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000101806  hitchhiker  0.00063854 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3043  hypothetical protein  38.96 
 
 
225 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0096  hypothetical protein  44.28 
 
 
209 aa  158  6e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.740238  hitchhiker  0.00737296 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3053  hypothetical protein  38.5 
 
 
225 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2077  hypothetical protein  45.81 
 
 
191 aa  153  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1805  hypothetical protein  43.52 
 
 
209 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.251054  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0656  hypothetical protein  42.05 
 
 
209 aa  149  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0459  Protein of unknown function DUF1847  36.22 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2927  Protein of unknown function DUF1847  46.85 
 
 
196 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.727853 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1137  hypothetical protein  38.17 
 
 
200 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000486783  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1395  hypothetical protein  45.77 
 
 
199 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1050  hypothetical protein  40.11 
 
 
197 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0564  hypothetical protein  38.35 
 
 
167 aa  99  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129187  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0637  hypothetical protein  37.84 
 
 
177 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>