64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0100 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  89.5 
 
 		 619 aa  1178    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  74.33 
 
 		 616 aa  952    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  74.51 
 
 		 616 aa  960    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  82.39 
 
 		 618 aa  1080    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  66.17 
 
 		 615 aa  830    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  100 
 
 		 618 aa  1289    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  37.99 
 
 		 688 aa  391  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  37.63 
 
 		 670 aa  380  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  36.32 
 
 		 689 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  36.11 
 
 		 729 aa  358  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  37.65 
 
 		 688 aa  353  5e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  33.63 
 
 		 662 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  33.89 
 
 		 655 aa  327  5e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  29.93 
 
 		 757 aa  226  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  28.92 
 
 		 658 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  29.55 
 
 		 566 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  29.45 
 
 		 566 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  28.47 
 
 		 577 aa  207  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  29.04 
 
 		 571 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  32.36 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3925  hypothetical protein  33.19 
 
 		 236 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  29.82 
 
 		 346 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  29.82 
 
 		 346 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  29.82 
 
 		 346 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1962  deca-heme C-type cytochrome-like protein  28.7 
 
 		 241 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.282752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2001  deca-heme C-type cytochrome-like  28.7 
 
 		 241 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1877  deca-heme C-type cytochrome-like protein  28.7 
 
 		 241 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14633  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1806  deca-heme C-type cytochrome-like protein  31.3 
 
 		 247 aa  97.4  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.655576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  34.4 
 
 		 211 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  26.53 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  27.49 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000703284  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1577  cytochrome c family protein  23.08 
 
 		 372 aa  56.2  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0594  cytochrome c family protein  30.77 
 
 		 349 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  25.42 
 
 		 712 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  25.74 
 
 		 883 aa  51.6  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  27.32 
 
 		 307 aa  51.2  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  25.42 
 
 		 806 aa  50.8  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  22.56 
 
 		 427 aa  50.8  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  28.03 
 
 		 658 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  25.68 
 
 		 315 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  26.98 
 
 		 487 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  22.57 
 
 		 621 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  26.24 
 
 		 374 aa  48.5  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2902  hypothetical protein  23.85 
 
 		 153 aa  48.1  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0689  multiheme cytochrome  23.91 
 
 		 359 aa  47.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000324131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  27.84 
 
 		 436 aa  47.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3156  hypothetical protein  24.24 
 
 		 154 aa  47.4  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0676  multihaem cytochrome  23.91 
 
 		 359 aa  47.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2898  cytochrome c family protein  23.9 
 
 		 330 aa  47.4  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808902  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2734  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  25.31 
 
 		 189 aa  46.6  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  23.27 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2431  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  26.43 
 
 		 189 aa  47  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  22.81 
 
 		 930 aa  47  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3839  cytochrome C family protein  22.96 
 
 		 330 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  29.06 
 
 		 577 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  21.78 
 
 		 370 aa  45.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3188  multiheme cytochrome  27.86 
 
 		 189 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.167986  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  23.91 
 
 		 646 aa  45.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1648  cytochrome c family protein  24 
 
 		 270 aa  45.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  24.45 
 
 		 322 aa  44.3  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  24.71 
 
 		 286 aa  44.3  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  28.04 
 
 		 321 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  28.57 
 
 		 1106 aa  43.9  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  28.04 
 
 		 319 aa  43.5  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>