23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0093 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0007  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  373  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.860463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0093  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  373  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392722  hitchhiker  0.000145622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0708  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  374  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2256  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  374  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000262117  hitchhiker  0.0000000000169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2593  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  374  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3081  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  374  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3824  hypothetical protein  40.88 
 
 		 390 aa  134  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000051596  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3217  hypothetical protein  40.88 
 
 		 390 aa  134  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2535  hypothetical protein  40.88 
 
 		 390 aa  134  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2477  hypothetical protein  40.88 
 
 		 390 aa  134  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00863555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2464  hypothetical protein  40.88 
 
 		 390 aa  134  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1788  hypothetical protein  40.88 
 
 		 390 aa  134  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000460947  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5439  integrase catalytic subunit  39.34 
 
 		 278 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.298779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4711  Integrase catalytic region  34.85 
 
 		 277 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.988899  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4903  Integrase catalytic region  34.85 
 
 		 277 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  29.87 
 
 		 320 aa  45.4  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0603  integrase catalytic subunit  33.82 
 
 		 271 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  32.86 
 
 		 273 aa  44.7  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  32.86 
 
 		 273 aa  44.7  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  32.86 
 
 		 273 aa  44.7  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  29.07 
 
 		 325 aa  41.6  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  29.07 
 
 		 325 aa  41.6  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  35.82 
 
 		 263 aa  41.2  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>