28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0083 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0083  Band 7 protein  100 
 
 		 830 aa  1682    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.148744  hitchhiker  0.00195276 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5247  band 7 protein  31.07 
 
 		 691 aa  337  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1605  band 7 protein  31.07 
 
 		 691 aa  337  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.608323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1093  band 7 protein  33.97 
 
 		 650 aa  324  4e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.807858  normal  0.192088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0317  band 7 protein  32.13 
 
 		 646 aa  300  6e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2967  hypothetical protein  32.55 
 
 		 689 aa  281  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2133  band 7 protein  31.01 
 
 		 647 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2023  band 7 protein  29.03 
 
 		 658 aa  238  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5721  band 7 protein  29.46 
 
 		 681 aa  234  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0977085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  32.9 
 
 		 1204 aa  231  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0142  band 7 protein  30.85 
 
 		 673 aa  209  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7328  band 7 protein  28.52 
 
 		 660 aa  204  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7215  hypothetical protein  26.24 
 
 		 659 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4145  hypothetical protein  83.72 
 
 		 103 aa  139  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.946953  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3347  band 7 protein  26.38 
 
 		 539 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.953991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2032  band 7 protein  26.84 
 
 		 303 aa  63.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.953686 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2498  band 7 protein  29.26 
 
 		 316 aa  59.7  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4917  band 7 protein  25.26 
 
 		 301 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.149772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1830  band 7 protein  25.56 
 
 		 303 aa  53.9  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2467  band 7 protein  28.57 
 
 		 318 aa  52.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0849083 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1572  SPFH/band 7 family protein  23.14 
 
 		 295 aa  49.7  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.915425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2721  band 7 protein  23.14 
 
 		 308 aa  48.9  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000149129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2636  SPFH/band 7 family protein  23.14 
 
 		 308 aa  48.9  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156489  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0362  band 7 protein  23.64 
 
 		 321 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0854  cation-transporting ATPase, P-type  24.75 
 
 		 364 aa  45.4  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0303  SPFH domain-containing protein  23.86 
 
 		 364 aa  45.4  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4200  band 7 protein  24.88 
 
 		 268 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.525075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0444  band 7 protein  22.02 
 
 		 295 aa  44.7  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>