265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0068 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0068  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 194 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.979316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3375  mutT/nudix family protein  72.35 
 
 		 171 aa  257  8e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3526  NUDIX hydrolase  64.09 
 
 		 187 aa  237  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3592  NUDIX hydrolase  64.24 
 
 		 177 aa  212  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  46.99 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 		 241 aa  136  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  41.4 
 
 		 231 aa  127  7.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  43.53 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  40.13 
 
 		 245 aa  121  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1289  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  42.58 
 
 		 227 aa  118  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  42.58 
 
 		 226 aa  118  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  40.26 
 
 		 223 aa  117  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  41.14 
 
 		 243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2481  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 		 195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00475153  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2968  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 		 216 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.713083  normal  0.0271269 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2622  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.831356  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  44.79 
 
 		 200 aa  114  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01947  NTP pyrophosphohydrolase, NUDIX family protein  39.35 
 
 		 190 aa  114  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00222276  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4187  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  40.37 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2230  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  38.36 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0594  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0812937  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1073  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.398605  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1032  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2661  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 		 207 aa  111  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.975355  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 		 207 aa  111  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 228 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0685  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.997472 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0953  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0994513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  36.18 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2273  NUDIX hydrolase  31.55 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.456189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3054  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 		 216 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0331862 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.61 
 
 		 483 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4112  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0690871  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.61 
 
 		 427 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  41.21 
 
 		 427 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  37.5 
 
 		 199 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.61 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.61 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1206  putative phosphohydrolase (mutT/nudix family protein)  40.4 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00244192  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4241  NUDIX hydrolase  37.57 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  37.66 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1010  hypothetical protein  38.15 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.61 
 
 		 333 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  35.18 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  40.61 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  37.8 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  34.66 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1665  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.04 
 
 		 347 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3488  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1611  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.404735  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2177  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  35.84 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2790  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235631 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0727  NUDIX hydrolase  36.48 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1554  MutT/nudix family protein  35.53 
 
 		 168 aa  104  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.607858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1502  MutT/nudix family protein  35.53 
 
 		 168 aa  104  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.73233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  37.42 
 
 		 195 aa  104  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1032  hypothetical protein  33.84 
 
 		 214 aa  104  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  34.81 
 
 		 197 aa  104  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 197 aa  104  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  39.61 
 
 		 199 aa  104  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  39.61 
 
 		 199 aa  104  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  39.61 
 
 		 199 aa  104  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 		 234 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  35.5 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2867  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.321324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  36.77 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1345  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2644  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.688454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4477  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  hitchhiker  0.00156335 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1193  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 285 aa  101  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 239 aa  101  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1969  hypothetical protein  37.66 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1491  hypothetical protein  37.66 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1306  hypothetical protein  37.66 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185937  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  38.31 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1965  hypothetical protein  37.66 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2026  hypothetical protein  37.66 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  36.36 
 
 		 227 aa  101  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 		 235 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2624  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  32.45 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  30.64 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>