More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0065 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3372  cardiolipin synthetase, putative  75 
 
 		 480 aa  743    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0065  cardiolipin synthetase 2  100 
 
 		 477 aa  966    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  68.83 
 
 		 478 aa  669    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  64.49 
 
 		 474 aa  579  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  58.06 
 
 		 483 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  65.33 
 
 		 374 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0507  cardiolipin synthase  53.83 
 
 		 479 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5389  phospholipase D/Transphosphatidylase  55.32 
 
 		 477 aa  489  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160876  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0590  cardiolipin synthetase 2  48.43 
 
 		 484 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1528  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.17 
 
 		 489 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  49.58 
 
 		 477 aa  430  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0978  phospholipase D/transphosphatidylase  48.68 
 
 		 472 aa  429  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0576859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.26 
 
 		 477 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  49.35 
 
 		 502 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4398  phospholipase D/Transphosphatidylase  50 
 
 		 464 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  47.47 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4375  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.57 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.89 
 
 		 474 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  46.72 
 
 		 476 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4391  phospholipase D/transphosphatidylase  47.22 
 
 		 481 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0531581  normal  0.277107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1467  phospholipase D/transphosphatidylase  39.87 
 
 		 484 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.37 
 
 		 472 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0531  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.59 
 
 		 474 aa  362  6e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1169  cardiolipin synthetase 2  42.34 
 
 		 476 aa  356  5e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.965862  normal  0.953027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0625  phospholipase D/Transphosphatidylase  42.34 
 
 		 476 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.062967  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3392  phospholipase D/transphosphatidylase  41.91 
 
 		 476 aa  349  8e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2292  phospholipase D/transphosphatidylase  41.79 
 
 		 476 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1683  phospholipase D/transphosphatidylase  41.23 
 
 		 474 aa  347  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1882  phospholipase D/transphosphatidylase  41.25 
 
 		 482 aa  345  8e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.121279  normal  0.833086 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1339  phospholipase D/transphosphatidylase  37.82 
 
 		 500 aa  343  5e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362652  hitchhiker  0.000013875 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1060  cardiolipin synthase  41.1 
 
 		 486 aa  342  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4952  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.04 
 
 		 478 aa  342  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal  0.618328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0495  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.83 
 
 		 478 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.254472  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1682  phospholipase D/transphosphatidylase  41.42 
 
 		 474 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0998  cardiolipin synthase  40.68 
 
 		 486 aa  338  9e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2153  phospholipase D/transphosphatidylase  42.41 
 
 		 486 aa  333  4e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1323  phospholipase D/transphosphatidylase  40.94 
 
 		 486 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4902  phospholipase D/Transphosphatidylase  40.17 
 
 		 478 aa  330  4e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0190  phospholipase D/Transphosphatidylase  39.39 
 
 		 472 aa  329  6e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.340705  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4438  phospholipase D/transphosphatidylase  40.17 
 
 		 478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.654501  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6774  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.7 
 
 		 487 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5869  phospholipase D/Transphosphatidylase  41.7 
 
 		 487 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1155  phospholipase D/transphosphatidylase  40.25 
 
 		 487 aa  321  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.894143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0386  phospholipase D/transphosphatidylase  41.16 
 
 		 467 aa  318  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2878  cardiolipin synthase  39.53 
 
 		 482 aa  316  6e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  40.52 
 
 		 467 aa  300  4e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0728  phospholipase D/transphosphatidylase  39.92 
 
 		 478 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.117889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0337  phospholipase D/transphosphatidylase  33.83 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.505501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0844  phospholipase D/transphosphatidylase  31.53 
 
 		 486 aa  272  1e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0550456 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1246  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.31 
 
 		 541 aa  256  9e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0766  cardiolipin synthetase  31.45 
 
 		 502 aa  251  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1441  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.8 
 
 		 485 aa  248  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0508  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.62 
 
 		 483 aa  245  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.41 
 
 		 425 aa  244  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4553  cardiolipin synthetase  34.73 
 
 		 481 aa  243  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12853  cardiolipin synthetase  30.04 
 
 		 483 aa  243  7.999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.427417  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03470  cardiolipin synthetase  32.05 
 
 		 486 aa  242  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1592  cardiolipin synthetase 2  31.4 
 
 		 499 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.273081  hitchhiker  0.0042538 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0446  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.71 
 
 		 477 aa  240  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.37 
 
 		 472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2453  cardiolipin synthetase  32.05 
 
 		 485 aa  240  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0078  phospholipase D/transphosphatidylase  36.92 
 
 		 462 aa  239  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0752  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.9 
 
 		 492 aa  239  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2441  phospholipase D/transphosphatidylase  32.92 
 
 		 477 aa  238  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0012  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.23 
 
 		 486 aa  239  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321981 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1088  cardiolipin synthetase  30.53 
 
 		 514 aa  237  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1882  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.08 
 
 		 482 aa  237  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.594406  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0907  cardiolipin synthetase  30.67 
 
 		 514 aa  238  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1274  cardiolipin synthetase  30.32 
 
 		 514 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1350  cardiolipin synthetase  30.32 
 
 		 514 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1312  cardiolipin synthetase  30.32 
 
 		 514 aa  236  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1112  cardiolipin synthetase  30.32 
 
 		 514 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1094  cardiolipin synthetase  30.32 
 
 		 514 aa  236  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1204  cardiolipin synthetase  30.32 
 
 		 514 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0786  putative cardiolipin synthetase  36.78 
 
 		 420 aa  236  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.438508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4096  cardiolipin synthetase  30.11 
 
 		 514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.94 
 
 		 478 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4470  phospholipase D/Transphosphatidylase  35.97 
 
 		 420 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1100  cardiolipin synthetase  30.32 
 
 		 514 aa  233  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1621  cardiolipin synthetase  30.52 
 
 		 502 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1245  cardiolipin synthetase  30.11 
 
 		 514 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1353  cardiolipin synthetase  31.95 
 
 		 478 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1835  cardiolipin synthetase  32.26 
 
 		 474 aa  231  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2328  phospholipase D/transphosphatidylase  31.52 
 
 		 480 aa  230  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114921  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1216  phospholipase D/transphosphatidylase  36.51 
 
 		 420 aa  230  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4283  cardiolipin synthetase  31.52 
 
 		 477 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.551808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5665  cardiolipin synthetase  32.08 
 
 		 479 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.549714  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4171  cardiolipin synthetase  31.52 
 
 		 477 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.630985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1935  cardiolipin synthetase  31.77 
 
 		 479 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1434  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.99 
 
 		 445 aa  227  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2471  cardiolipin synthetase  32.14 
 
 		 483 aa  228  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.568406  decreased coverage  0.0000239654 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0539  cardiolipin synthetase  31.03 
 
 		 509 aa  227  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2053  cardiolipin synthetase  32.22 
 
 		 479 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1740  phospholipase D family protein  32.81 
 
 		 458 aa  226  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0754  cardiolipin synthetase  30.49 
 
 		 509 aa  226  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1046  cardiolipin synthetase 2  30.6 
 
 		 481 aa  226  9e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0310152  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1231  phospholipase D/transphosphatidylase  31.33 
 
 		 490 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.332876  normal  0.0440923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5272  cardiolipin synthetase  32.35 
 
 		 479 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0694  cardiolipin synthetase  30.28 
 
 		 509 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5343  cardiolipin synthetase  32.02 
 
 		 479 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>