218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0039 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2485  potassium transporter family protein  86.78 
 
 		 605 aa  1080    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0372664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3346  potassium uptake protein, Kup system  70.96 
 
 		 610 aa  882    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3121  K potassium transporter  69.45 
 
 		 606 aa  886    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3491  potassium uptake protein Kup  61.73 
 
 		 603 aa  755    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177309  normal  0.248816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3758  K potassium transporter  66.5 
 
 		 606 aa  856    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3651  K potassium transporter  66.5 
 
 		 606 aa  855    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00232162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0038  K+ potassium transporter  70.13 
 
 		 605 aa  879    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0039  K+ potassium transporter  100 
 
 		 606 aa  1217    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.569614 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0881  K+ potassium transporter  54.29 
 
 		 611 aa  650    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.540228  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2224  K potassium transporter  54.04 
 
 		 604 aa  661    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0532  K potassium transporter  70.63 
 
 		 606 aa  910    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0358853  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3222  K potassium transporter  69.31 
 
 		 606 aa  895    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0209954  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0610  K+ potassium transporter  73.6 
 
 		 605 aa  919    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000434273  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1714  K potassium transporter  58.72 
 
 		 608 aa  703    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00063361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4312  K+ potassium transporter  76.53 
 
 		 605 aa  972    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3225  K potassium transporter  72.61 
 
 		 606 aa  917    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00665518  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1173  K potassium transporter  69.31 
 
 		 606 aa  895    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1365  K+ potassium transporter  57.24 
 
 		 597 aa  699    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.790927  normal  0.29009 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1248  K potassium transporter  43.46 
 
 		 607 aa  489  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.935948  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2547  K potassium transporter  36.95 
 
 		 625 aa  350  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3125  K potassium transporter  36.54 
 
 		 639 aa  347  3e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5996  K potassium transporter  34.96 
 
 		 627 aa  341  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106648  hitchhiker  0.00272836 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0508  K potassium transporter  35.35 
 
 		 632 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01558  potassium uptake protein  36.6 
 
 		 614 aa  339  7e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.509274  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3417  K potassium transporter  38.15 
 
 		 634 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120836  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0551  K potassium transporter  34.92 
 
 		 632 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.861026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1885  K potassium transporter  36.12 
 
 		 622 aa  336  5.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.508127  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1232  K potassium transporter  36.62 
 
 		 636 aa  336  7e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0572  K potassium transporter  37.41 
 
 		 620 aa  336  7.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3932  K potassium transporter  33.97 
 
 		 672 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0963001  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0943  K potassium transporter  36.06 
 
 		 634 aa  335  2e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6870  K potassium transporter  35.63 
 
 		 633 aa  334  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5868  K potassium transporter  35.9 
 
 		 633 aa  333  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2350  potassium uptake protein, Kup system  36.12 
 
 		 631 aa  332  9e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00598886  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1062  potassium uptake protein  35.58 
 
 		 634 aa  332  1e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0485  K+ potassium transporter  35.77 
 
 		 630 aa  332  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3454  Kup family low affinity potassium transporter  34.08 
 
 		 611 aa  331  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5940  K potassium transporter  35.96 
 
 		 633 aa  331  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0821691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2512  K+ potassium transporter  34.12 
 
 		 620 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201429  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3436  K potassium transporter  33.81 
 
 		 620 aa  329  9e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0308  K potassium transporter  36.1 
 
 		 637 aa  329  9e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.938116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1394  K+ potassium transporter  34.03 
 
 		 648 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1537  K potassium transporter  36.85 
 
 		 637 aa  327  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1184  K+ potassium transporter  35.74 
 
 		 621 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0179  K potassium transporter  36.16 
 
 		 637 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4765  K potassium transporter  34.69 
 
 		 652 aa  327  4.0000000000000003e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.266428 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0201  K+ potassium transporter  36.19 
 
 		 632 aa  327  5e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1334  K+ potassium transporter  35.74 
 
 		 636 aa  326  7e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.508351  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2932  K+ potassium transporter  33.71 
 
 		 620 aa  326  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00598935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3512  Kup family low affinity potassium transporter  35.01 
 
 		 632 aa  326  9e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1753  potassium uptake protein  35.48 
 
 		 644 aa  326  9e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.909141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2102  K+ potassium transporter  33.55 
 
 		 630 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1253  K+ potassium transporter  34.6 
 
 		 622 aa  325  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1856  K+ potassium transporter  34.29 
 
 		 620 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3909  K+ potassium transporter  33.28 
 
 		 622 aa  324  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000284388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3258  K potassium transporter  33.28 
 
 		 622 aa  324  2e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0402943  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2065  potassium uptake protein  35.83 
 
 		 624 aa  324  3e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1383  potassium uptake protein  33.33 
 
 		 651 aa  323  7e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601106  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5357  K potassium transporter  33.81 
 
 		 656 aa  323  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00124872  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2692  K+ potassium transporter  37.27 
 
 		 634 aa  323  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0189185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0927  potassium uptake protein  35.56 
 
 		 634 aa  323  8e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137865  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1811  K potassium transporter  33.86 
 
 		 651 aa  323  8e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4582  K+ potassium transporter  33.98 
 
 		 622 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3749  K+ potassium transporter  33.87 
 
 		 622 aa  322  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1339  potassium uptake protein  33.17 
 
 		 651 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4541  K+ potassium transporter  32.81 
 
 		 622 aa  320  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2061  K+ potassium transporter  33.88 
 
 		 644 aa  321  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.266591  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2302  hypothetical protein  35.54 
 
 		 629 aa  320  3.9999999999999996e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1231  K+ potassium transporter  35.52 
 
 		 656 aa  320  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0916765  normal  0.143534 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2446  hypothetical protein  35.54 
 
 		 629 aa  320  6e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1643  K potassium transporter  33.81 
 
 		 670 aa  319  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0444  K potassium transporter  32.74 
 
 		 630 aa  319  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0753432 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3517  K potassium transporter  34.24 
 
 		 628 aa  318  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00569528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4902  potassium transport protein Kup  34.23 
 
 		 622 aa  318  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  hitchhiker  0.000280995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3556  K+ potassium transporter  35.92 
 
 		 626 aa  318  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1777  K+ potassium transporter  35.32 
 
 		 637 aa  318  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.150032  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1512  K+ potassium transporter  32.95 
 
 		 653 aa  317  3e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312861  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1463  K+ potassium transporter  35.53 
 
 		 647 aa  317  3e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.954899  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1877  K potassium transporter  33.81 
 
 		 668 aa  317  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.119842  normal  0.0678898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1596  K potassium transporter  33.81 
 
 		 668 aa  316  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.923122  normal  0.0938769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52400  potassium uptake protein Kup  34.8 
 
 		 634 aa  316  6e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.668346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4242  potassium transport protein Kup  36.56 
 
 		 622 aa  316  7e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4594  potassium uptake protein Kup  35.06 
 
 		 634 aa  316  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0174  potassium uptake protein  33.97 
 
 		 628 aa  316  9e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4532  potassium transport protein Kup  36.03 
 
 		 622 aa  313  5.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.336747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0427  K potassium transporter  35.78 
 
 		 639 aa  312  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4211  potassium transport protein Kup  35.5 
 
 		 622 aa  312  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0006  potassium transport protein Kup  35.5 
 
 		 622 aa  312  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0279816  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3993  potassium uptake protein  34.13 
 
 		 631 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1394  K+ potassium transporter  34.62 
 
 		 631 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.886731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0949  K+ potassium transporter  34.58 
 
 		 670 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.986532  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0985  K potassium transporter  33.33 
 
 		 680 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1122  K potassium transporter  36.58 
 
 		 569 aa  309  9e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0006  potassium transport protein Kup  34.84 
 
 		 622 aa  309  9e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0580063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2018  Kup system potassium uptake protein  36.77 
 
 		 643 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2327  K potassium transporter  36.33 
 
 		 658 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.163546 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0629  K potassium transporter  32.85 
 
 		 664 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0514546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0764  K+ potassium transporter  33.71 
 
 		 622 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44581  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5005  K potassium transporter  35.68 
 
 		 647 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00761853  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1808  K+ potassium transporter  31.94 
 
 		 661 aa  308  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223984  normal  0.703155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>