19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0026 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0026  hypothetical protein  100 
 
 
90 aa  185  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.33751e-09  normal  0.852253 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3336  hypothetical protein  85.56 
 
 
90 aa  164  3e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.051495  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4304  hypothetical protein  77.78 
 
 
90 aa  149  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.80158e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0247  uncharacterized protein-like protein  74.44 
 
 
90 aa  144  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.37901e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0231  protein of unknown function DUF507  73.33 
 
 
90 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1310  hypothetical protein  53.41 
 
 
86 aa  97.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  7.33795e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0079  hypothetical protein  35.29 
 
 
183 aa  66.6  1e-10  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.11602  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1843  hypothetical protein  36.05 
 
 
183 aa  65.1  3e-10  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1487  hypothetical protein  36.05 
 
 
183 aa  65.1  3e-10  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1668  hypothetical protein  36.05 
 
 
183 aa  65.1  3e-10  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0371  conserved hypothetical protein (DUF507 domain protein)  34.88 
 
 
183 aa  62.4  2e-09  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1924  protein of unknown function DUF507  34.12 
 
 
184 aa  58.9  2e-08  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0718  competence/damage-inducible domain-containing protein  30.59 
 
 
183 aa  59.3  2e-08  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185967  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0896  hypothetical protein  31.76 
 
 
183 aa  59.3  2e-08  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1366  hypothetical protein  30.59 
 
 
183 aa  59.3  2e-08  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0373  hypothetical protein  32.94 
 
 
183 aa  57.4  6e-08  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0598173  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4175  hypothetical protein  32.56 
 
 
105 aa  53.9  7e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.570321  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1146  protein of unknown function DUF507  25.29 
 
 
182 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0092  hypothetical protein  29.29 
 
 
99 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  1.00169e-05  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>