More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0021 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0021  ATPase associated with various cellular activities  100 
 
 		 272 aa  547  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.954404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3309  hypothetical protein  93.36 
 
 		 272 aa  518  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00793915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0171  ATPase  89.67 
 
 		 272 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0037  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  85.24 
 
 		 272 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0036  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  85.24 
 
 		 272 aa  474  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0967142 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2642  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  82.35 
 
 		 272 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.807875  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1102  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  60.51 
 
 		 281 aa  341  5.999999999999999e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000686062  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3634  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.09 
 
 		 340 aa  314  9e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  30.62 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  31.32 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  30.99 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3075  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.81 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0611881  decreased coverage  0.0000000372935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.64 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.93 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  31.45 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.38 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.5 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  27.59 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  31.79 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.38 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.35 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  37.29 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  28.02 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  28.02 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  30.97 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  31.58 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  30.94 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.32 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  28.43 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.77 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  28.76 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  27.86 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  29.61 
 
 		 4844 aa  58.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4915  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.92 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487273  normal  0.572673 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  25.23 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  26.5 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1000  ATPase  26.77 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.270469 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  31.54 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1092  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.38 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  32.73 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.33 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0535  ATPase  28.14 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000789925  normal  0.392501 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.59 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0687  ATPase  31.47 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.139478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.32 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  27.22 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1685  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.26 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.942326 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  26.26 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  23.71 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  23.41 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  32.67 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.76 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  27.55 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.18 
 
 		 327 aa  57  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  27.31 
 
 		 331 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.61 
 
 		 320 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1795  ATPase  28.02 
 
 		 346 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.36 
 
 		 351 aa  57  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.24 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1353  ATPase  25.19 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130927  hitchhiker  0.00000046022 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  29.94 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  30.06 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1205  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.1 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.24 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.13 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  27.2 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  25.62 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  26.97 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.79 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  28.45 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  27.41 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  28.02 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1651  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.11 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.76 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0659  ATPase  29.8 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.936381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  24.75 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.57 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  28.86 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3073  ATPase  26.63 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  28.06 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  28.29 
 
 		 347 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2449  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.27 
 
 		 349 aa  55.5  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.281156  decreased coverage  0.00339489 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  27.03 
 
 		 340 aa  55.5  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  38.54 
 
 		 4917 aa  55.5  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  31.93 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0413  methanol dehydrogenase regulatory protein  27.5 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.81 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.94 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  0.00000222341 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  29.81 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4249  ATPase  28.1 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.518241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  26.79 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  27.68 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  29.44 
 
 		 356 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  32.28 
 
 		 260 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  29.14 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  27.15 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  28.57 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  29.8 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.17 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2157  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>