More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0019 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0019  ferrochelatase  100 
 
 
317 aa  651    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3312  ferrochelatase  87.26 
 
 
317 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00205193  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0173  ferrochelatase  76.75 
 
 
319 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0039  ferrochelatase  67.09 
 
 
317 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0038  ferrochelatase  67.09 
 
 
317 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0641223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2715  ferrochelatase  66.88 
 
 
322 aa  428  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2930  ferrochelatase  65.27 
 
 
316 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0845  ferrochelatase  46.87 
 
 
335 aa  287  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000855481  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1503  ferrochelatase  47.45 
 
 
312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2167  ferrochelatase  46.52 
 
 
387 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0770  ferrochelatase  46.69 
 
 
352 aa  279  5e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154008  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0320  ferrochelatase  45.94 
 
 
387 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0327  ferrochelatase  45.94 
 
 
387 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4517  ferrochelatase  46.71 
 
 
387 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000264771  normal  0.473035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1574  ferrochelatase  44.51 
 
 
388 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.634764 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4313  ferrochelatase  45.45 
 
 
387 aa  266  4e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0137  ferrochelatase  44.51 
 
 
387 aa  263  3e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.746072  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2095  ferrochelatase  43.99 
 
 
387 aa  263  4e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2831  predicted protein  44.38 
 
 
366 aa  263  4e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00315896  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05821  ferrochelatase  42.81 
 
 
391 aa  262  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1857  ferrochelatase  42.81 
 
 
391 aa  261  8e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.89761  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05891  ferrochelatase  44.27 
 
 
391 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.979598  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07661  ferrochelatase  43.3 
 
 
391 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0342613 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45357  predicted protein  44.18 
 
 
509 aa  259  4e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0976017  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1643  ferrochelatase  42.99 
 
 
391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0716  ferrochelatase  43.3 
 
 
391 aa  252  5.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05811  ferrochelatase  42.41 
 
 
391 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0862606  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05511  ferrochelatase  42.55 
 
 
391 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0525  ferrochelatase  42.72 
 
 
391 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.703212  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05281  ferrochelatase  40.81 
 
 
391 aa  241  9e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1186  ferrochelatase  42.22 
 
 
315 aa  237  2e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1198  ferrochelatase  42.94 
 
 
443 aa  233  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01700  ferrochelatase, putative  41.12 
 
 
413 aa  231  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2474  ferrochelatase  40.19 
 
 
362 aa  229  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0132426  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1130  ferrochelatase  41.53 
 
 
319 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.104879  hitchhiker  0.00676039 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3617  ferrochelatase  42.37 
 
 
362 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1258  ferrochelatase  41.74 
 
 
348 aa  219  7e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1670  ferrochelatase  38.99 
 
 
312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0790  ferrochelatase  41.16 
 
 
325 aa  208  9e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07752  mitochondrial ferrochelatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07750)  38.14 
 
 
419 aa  207  3e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.412365 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0918  ferrochelatase  35.33 
 
 
316 aa  205  8e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101664  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2972  ferrochelatase  36.99 
 
 
346 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36859  ferrochelatase precursor  37.54 
 
 
354 aa  201  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5017  ferrochelatase  39.87 
 
 
348 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400702  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1090  ferrochelatase  41.77 
 
 
320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1218  Ferrochelatase  42.04 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0623  ferrochelatase  35.62 
 
 
337 aa  196  5.000000000000001e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.235291  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1149  Ferrochelatase  41.72 
 
 
320 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0988  ferrochelatase  35.96 
 
 
312 aa  190  2e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0053  ferrochelatase  37.91 
 
 
317 aa  190  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0395  ferrochelatase  34.58 
 
 
343 aa  187  2e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2206  ferrochelatase  32.81 
 
 
330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0613952  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0703  ferrochelatase  33.54 
 
 
314 aa  178  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2090  ferrochelatase  35.13 
 
 
306 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3547  ferrochelatase  31.35 
 
 
305 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0610  ferrochelatase  35.71 
 
 
303 aa  162  7e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.926829  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0531  ferrochelatase  35.71 
 
 
309 aa  162  9e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.95446  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0772  ferrochelatase  35.99 
 
 
317 aa  160  2e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.291247  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  33.54 
 
 
356 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  33.54 
 
 
356 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1069  ferrochelatase  36.59 
 
 
300 aa  160  3e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1433  ferrochelatase  35.71 
 
 
303 aa  159  4e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  33.54 
 
 
356 aa  159  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  33.64 
 
 
345 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  35.19 
 
 
398 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3692  Ferrochelatase  31.52 
 
 
348 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0282772 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  33.02 
 
 
344 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2030  ferrochelatase  33.12 
 
 
342 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.273433  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3498  ferrochelatase  31.9 
 
 
362 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.440479  normal  0.808064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2900  ferrochelatase  31.08 
 
 
354 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724237  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  32.3 
 
 
360 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4648  ferrochelatase  32.4 
 
 
360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2060  ferrochelatase  31.2 
 
 
354 aa  153  4e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000118171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  32.2 
 
 
337 aa  153  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  33.75 
 
 
355 aa  152  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2535  ferrochelatase  30.86 
 
 
340 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3606  ferrochelatase  32.92 
 
 
350 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3304  ferrochelatase  33.02 
 
 
344 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0153  ferrochelatase  31.2 
 
 
341 aa  151  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000811628  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  32.81 
 
 
345 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  32.09 
 
 
360 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  31.89 
 
 
327 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  32.71 
 
 
350 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  31.89 
 
 
327 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4842  ferrochelatase  33.44 
 
 
370 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3490  ferrochelatase  31.55 
 
 
344 aa  149  8e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  31.79 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  34.86 
 
 
365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4417  ferrochelatase  30.99 
 
 
357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0943  ferrochelatase  33.64 
 
 
345 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  32.52 
 
 
364 aa  147  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  30.63 
 
 
343 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1235  ferrochelatase  27.81 
 
 
319 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  34.77 
 
 
336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  31.27 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1208  ferrochelatase  28.21 
 
 
319 aa  146  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156856  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  32.3 
 
 
327 aa  146  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004135  ferrochelatase protoheme ferro-lyase  30.82 
 
 
320 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  31.46 
 
 
351 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1158  ferrochelatase  27.5 
 
 
319 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0772321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>