42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0017 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0017  SlyX  100 
 
 		 67 aa  137  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.643938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1436  SlyX family protein  46.27 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.423853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3452  hypothetical protein  69.77 
 
 		 43 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.407738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1717  SlyX family protein  46.27 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000834662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2502  SlyX family protein  44.78 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2909  SlyX family protein  38.81 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5924  hypothetical protein  43.28 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2678  SlyX  44.78 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.4298  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1134  SlyX family protein  42.86 
 
 		 63 aa  50.8  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.830125  normal  0.0936794 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1200  hypothetical protein  37.5 
 
 		 71 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0713  SlyX family protein  40.62 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2830  SlyX family protein  37.31 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159899  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0103  SlyX  35.21 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2193  SlyX family protein  35.94 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51850  hypothetical protein  35.82 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120935  hitchhiker  0.00317076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4054  SlyX family protein  35.94 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18660  hypothetical protein  32.84 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1372  hypothetical protein  34.85 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5298  SlyX family protein  36.76 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.629144  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0303  hypothetical protein  31.25 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0062  SlyX family protein  41.79 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.918474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1564  SlyX family protein  36.36 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4548  hypothetical protein  34.33 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0383  SlyX family protein  34.33 
 
 		 72 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.729915  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1262  hypothetical protein  37.88 
 
 		 68 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0728252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2555  SlyX family protein  32.84 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106736  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2956  hypothetical protein  42.62 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479909  normal  0.0513755 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0307  SlyX family protein  32.84 
 
 		 72 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.454596  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3168  SlyX family protein  37.5 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2515  SlyX family protein  37.5 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2763  hypothetical protein  29.85 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000693224  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4354  hypothetical protein  36.99 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00524601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4416  hypothetical protein  30 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00499452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3105  SlyX family protein  35.29 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343313  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03984  SlyX  30.3 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0425699  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1786  SlyX family protein  38.81 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1638  hypothetical protein  28.36 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00064  hypothetical protein  31.25 
 
 		 75 aa  40  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0288  SlyX protein, putative  35.8 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976971 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1314  hypothetical protein  36.62 
 
 		 68 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00260587  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1381  SlyX family protein  38.57 
 
 		 65 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.269795  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002290  protein SlyX  31.25 
 
 		 75 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000547395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>