More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3669 on replicon NC_010815
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010815  Glov_3669  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 127 aa  251  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1466  biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.45 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0559794  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  60.98 
 
 		 125 aa  144  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3062  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44 
 
 		 127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2667  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.27 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.8 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.435564 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0729  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.52 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120053  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0628  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.09 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.203844  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1369  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.48 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1241  TonB system transport protein ExbD  39.13 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.977225  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0393  TonB system transport protein ExbD  38.14 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0498331  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2158  TonB system transport protein ExbD  43.59 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0467  TonB system transport protein ExbD  35.04 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0277  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1650  TonB system transport protein ExbD  36.75 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.351181  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0690  biopolymer transport protein  34.15 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0276966  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0717  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.51 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0400  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.376121  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0848  TonB system transport protein ExbD  31.93 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000199461  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1623  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.01 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122502  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1543  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.81 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1568  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.05 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.969872  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2237  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.5 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.271991  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0872  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.68 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.532124  normal  0.142279 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.17 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1620  biopolymer transport exbD protein  33.33 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.916703  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1801  biopolymer transport exbD protein  32.48 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.221711  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1988  biopolymer transport exbD protein  32.48 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0352  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.88 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0388  biopolymer transport protein  33.88 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1730  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.59 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.1 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3905  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.2 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396754  normal  0.163087 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  37.88 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  37.88 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1397  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.23 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  37.12 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2919  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.59 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0661927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00589  biopolymer transport protein  31.4 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265658  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2991  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.59 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158684  normal  0.0282837 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0879  TonB system transport protein ExbD  27.35 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2569  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.43 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0105  TonB system transport protein ExbD, putative  33.86 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.664696  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  34.85 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0145  TonB system transport protein ExbD, putative  33.86 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057869  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0117  TonB system transport protein ExbD, putative  33.86 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000384782  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2221  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.59 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109447  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0283  TonB system transport protein ExbD  29.91 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2066  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.46 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1522  ExbDTolR family transport protein  30.83 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0915  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.574244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4055  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.5 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  31.71 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2891  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.33 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.123958 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  30.89 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.45 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  30.89 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2226  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.77 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.267348  hitchhiker  0.000328891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0784  protein TolR  34.92 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  33.87 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.87 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0173  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.46 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311198  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1896  TolR protein, membrane component  32.58 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2733  protein TolR  32.58 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0139663  hitchhiker  0.0000179602 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  35.2 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1158  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.16 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.399556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2673  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.16 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0273  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.6 
 
 		 136 aa  60.1  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  32.5 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0646  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.5 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0486  biopolymer transport protein, ExbD/TolR family  31.5 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244667  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.96 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0169  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.88 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.35841 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2772  biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.71 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.47 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0632  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.27 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2262  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  28.57 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.144392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2390  biopolymer transport protein  34.78 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.817875  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0358  biopolymer ExbD/TolR family transporter  33.06 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0309097 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0198  TonB system transport protein ExbD  30.58 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00125254  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.54 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.1 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.1 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  31.75 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0920  putative polysaccharide deacetylase  29.37 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0743675  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0997  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.01 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2608  biopolymer transport protein ExbD/TolR  30.47 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.15 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2106  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.31 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02686  Biopolymer transport protein  29.55 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00153637  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  31.4 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.41 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1370  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.92 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0197  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.65 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.058797  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2674  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.6 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1442  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.97 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1741  ExbDTolR family transport protein  28.57 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.490579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2540  protein TolR  30.3 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000662541  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1855  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.06 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126112  normal  0.766522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>